法律分析：在农村办食品加工厂的手续：1、首要要办理的几个必备手续：一是工商局的营业执照，这个是成立企业的。有些省份允许成立小作坊的合伙企业，有的省市要求必须成立有限公司。2、 二是生产许可证的获得：食品的生产，都要获得生产许可证之后才能生产。申请生产许可证是到本地食药监局（有的是市场监管局），具体申请流程到食药监局咨询即可。如果没有许可证就贸然生产销售，被发现了肯定是会被处罚的。3、 加工厂需要有相应的生产设备、仓储设备、消毒设备和质量管理人员、质量管理制度，这些需要自己提前准备好。4、食品工厂的员工，根据岗位情况，有些是需要取得健康证的。
法律依据：《中华人民共和国行政许可法》 第三十九条 行政机关作出准予行政许可的决定，需要颁发行政许可证件的，应当向申请人颁发加盖本行政机关印章的下列行政许可证件：
（一）许可证、执照或者其他许可证书；
（二）资格证、资质证或者其他合格证书；
（三）行政机关的批准文件或者证明文件；
（四）法律、法规规定的其他行政许可证件。
行政机关实施检验、检测、检疫的，可以在检验、检测、检疫合格的设备、设施、产品、物品上加贴标签或者加盖检验、检测、检疫印章。