南京气象学院是一本院校, 不是二本院校。南京气象学院的前身为1960年1月建立的南京大学气象学院，1963年5月， 南京大学气象学院分出,在南京江北龙王山下独立建校,更名为南京气象学院。1978年，该校被批准为全国重点高校; 2000年2月，体制划转为中国气象局与江苏省人民政府共建、以江苏省管理为主,是一所以大气科学和环境科学为特色,兼有其它相关学科的理、工为主的普通高等学校。2004年5月， 已更名为南京信息工程大学。
南京气象学院的学科建设:
从1978年至1999年，学校本科专业从4个增加到11个,拥有3个硕士学位授权点、2个博士授权点、设立大气科学- -级学科博士后科.研流动站，建立起了完善的本科、硕士、博士三级学位授权体系。
1977年，设立天气动力学、气候学、农业气象学和大气探测学4个专业,同时开办数学师资班。1978年增加大气物理学、物理师资班、英语师资班等本科专业，办天气动力学、气候学、大气探测学三个专科专业。
1999年，设立大气科学、应用气象学、计算机科学与技术、信息与计算科学、英语、信息工程、会计学、行政管理、环境科学、资源环境与城乡规划管理、物理学等11个本科专业，开办9个专科专业。
学校1981年拥有硕士学位授予权, 1994年拥有博士学位授予权, 1999年获准设立大气科学- -级学科博士后科研流动站,天气动力学、应用气象学、气候学、大气物理与大气环境等4个学科被评为中国气象局重点学科。
学校1993年被国务院学位委员会批准为博士学位授予权单位,天气动力学、大气物理学与大气环境专业分别于1994年、1998年被批准为博士学位授予点，使学校建立起了完善的本科、硕士、博士三级学位授权体系。1990年，大气科学、环境科学、大气物理与大气环境三个学科梯队被评为江苏省优秀学科梯队。2000年，学校设置了15个本科专业。2002年1月，学校气象学学科被评为国家重点学科。