有三个校区，三个有本科生的校区分别是：
1、金山校区，也就是校本部，在福州仓山区。
2、旗山校区，在福州闽侯县大学城。
3、安溪茶学院校区。在泉州安溪县。
安溪校区开设有专业茶学、商务经济学、管理科学、会计（茶学院）。
旗山校区专业则有工程管理、土木工程、交通工程、森林工程、物流工程、材料科学与工程、化学工程与工艺、木材科学与工程、轻化工程、新能源科学与工程。
金山校区除了上述其它专业4年都在金山校区（本部）。
学科建设：
截至2016年11月，学校共有2个国家重点学科、2个农业部重点学科、7个国家林业局重点学科，9个福建省特色重点学科、21个福建省重点学科和3个省级优势学科平台。
在全国第三轮学科评估中，1个学科进入全国前5名，4个学科进入全国前10名（植物保护、林学、林业工程、风景园林学），8个学科进入全国前20名，均占福建省属高校50%左右，排名第一。截止2021年5月，学校植物学与动物学、农业科学、化学、环境科学与生态学、工程学等5个学科进入ESI全球排名前1%。
学校设有11个一级学科博士点，25个一级学科硕士点，11个博士后科研流动站，硕士专业学位授权点10个（覆盖23个领域）。
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