台北到南京需要1小时40分钟
南京到北京大约需要1小时吧，都是直飞，台北桃园至南京的有周末包机。不过据说人很多，尽量提前，
也可以台北—上海，时间差不多的。
从台北直飞南京的机票价差还挺大的，便宜的一万新台币左右(已入税，约2100元人民币)就有了，短期旅游票，期限为一个月以内。
三个月票约3200人民币
年票差不多要5600-5700人民币(这是东方航空的价格)
以上是台湾查到的从台北到南京的机票票价，由港澳转机的价格也差不多，你参考一下。
ps.我是用4.8的汇率大约估算。
南京飞北京与上海飞北京的价格差不多的······上海可以提前预订到春秋航空的特价票，只限网上预订，99元，很划算，一般上午8点到10钟的飞机··················
这个您自己可虑·········
参考：根据签署的扩大两岸空中直航协议，两岸周末包机从2008年7月4日起正式实施，双方还同意在周末客运包机实施后3个月内就两岸货运包机进行协商，并就开通两岸定期直达航班进行协商。根据双方签署协议的规定，大陆方面同意先行开放北京、上海（浦东）、广州、厦门、南京5个航点，并陆续开放成都、重庆、杭州、大连、桂林、深圳，以及其他有市场需求的航点。中国台湾方面同意开放桃园、高雄小港、台中清泉岗、台北松山、澎湖马公、花莲、金门、台东等8个航点。双方同意在周末包机初期阶段，每周各飞18个往返班次，共36个往返班次。根据市场需求等因素适时增加班次。不过，每个航点和航空公司可以执飞几班还没有确定，包机承运人逐月申请飞行班次，每次飞行前15日提出申请。协议只是明确每周中国台湾方面至上海（浦东）的班次不超过9个往返班次；大陆方面至台中清泉岗的班次不超过6个往返班次。
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