同学你好，本人是微电子学在校研究生，下面向你讲一下我的见闻，希望对你有所帮助：
你所说的这两个区别在于所要学习和掌握的知识侧重点不同！
理学的电子科学与技术侧重于学习微电子方面的知识，更具体点是学习物理学和电子学的知识，但重点是物理学中半导体方面的知识，电子方面是要学习电子方面偏重于物理层次的东西，这个学科最终的培养目标是要学生从事电子方面物理层面的工作，如半导体器件工艺、集成电路制造工艺，结合你所说的“MP4。MID.手机之类的芯片”来说，就是怎么在工艺中造出它们来！
工学中的电气信息，较上面所说的，更高级一点（这里所说的高级不是说普通意义上的高级！它是相对于产品的生产流程结构来说的！），它主要是要完成电子产品设计方面，它的知识结构侧重于电子学的知识，如模拟电子技术数字电子技术，电机拖动，单片机，dsp等，它的培养目标是要学生以后从事电子产品的设计方面的工作，是一个从无到有的过程，是教给你怎样设计出一个电子产品，让它满足群众的需要（如mp3能满足人们听歌的需要）。
再结合你所说的“MP4。MID.手机之类的芯片”来说就是：我学习了“工学的电气信息”就可以设计“MP4。MID.手机之类的芯片”了，设计出来以后，我把它交给学习“理学的电子信息科学与技术”的来制造就行了！
这两种都属于电子学，但侧重点不同！
当然，以上我说的知识相对于你说的从事芯片的工作来说的，其实学习工学的“电气信息”就业是很广的，本科毕业的学生可以到“电力部门、通信行业、电路设计企业、电子研发单位”等行业就业，相对“理学的电子信息科学与技术”的就业面广，后者主要是从事电子产品研发和制造，但对于研究生来说“理学的电子信息科学与技术”就业是的工资可能更高点！
大学的话，向西安电子科技大学、成都电子科大这是最强的，因为它们就是从电子开始起家的，另外北京邮电大学，东南大学等都行，这个可以从百度中直接搜到的，我给你个链接，是07年的排名，注意参考一下：
http://www.examda.com/Kaoyan/zhinan/College/20090527/135045800.html在你报考时，如果你想继续深造，本科后考研，那我建议你报考“理学的电子信息科学与技术”，如果你想本科后就找个工作安定下来，那我建议你报考工学的电气信息！
再补充几句：现在电子学方面很热的，就业挺好，可以考虑向这方面发展的。而且你也能想象一下，随着人们生活的改善，人们需求的电子产品是越来越多，因此电子方面的前途不会坏的！
小兄弟，不知道我所说的你能听懂不？希望对你有所帮助啊！也祝愿你前途似锦！