2009年区划调整后,辖6个街道、2个镇、2个乡。
南城镇 面积 3.80平方千米,人口 7765人。浦南镇面积104平方公里, 人口 5.4万人
云台乡 面积58.12平方千米,人口32971人。
花果山乡 面积33.30平方千米,人口15014人。
此外还有省级农场岗埠农场
2013年1月连云港市政府为加快城市化进程,对行政区划作新一轮调整。此调整涉及新浦区3个乡镇。
撤销花果山乡,设立花果山街道办事处。调整后行政区域面积为39.7平方公里,人口2.08万人,辖新滩、当路、飞泉、前进、新村、小村、前云7个村民委员会和大村居民委员会。
撤销南城镇,设立南城街道办事处。调整后行政区域面积为4.7平方公里,人口7299人,辖宁海、凤凰、青春3个居民委员会。
撤销云台乡,设立云台街道办事处。划调整后行政区域面积为59.5平方公里,人口3.2万人,辖西山、丹霞、前关、后关、山东、东磊、渔湾、朱麻、凤凰9个村民委员会和凌州居民委员会。
从此新浦区乡镇由原来的6个街道、2个镇、2个乡调整为 9个街道、1个镇。分别为:浦东街道、浦西街道、新东街道、新南街道、路南街道、新海街道、花果山街道、南城街道、云台街道、浦南镇;以及云台农场、南云台林场、岗埠农场。