柯南剧场版最好看排名如下：
1、贝克街的亡灵
这是一部真正做到柯南和福尔摩斯联动的剧场版。人工智能这个当时很超前的概念，在这一部中玩的还相当熟练。让现实和虚拟结合其实是一场游戏。用五十个上流阶层孩子的性命当赌注，来挑战虚拟和现实。
虚拟是柯南等人回到福尔摩斯的世界，去追踪著名的连环杀手“开膛手杰克”。也是柯南唯一一次没有运用自己任何一个先进道具的剧场版。全靠自己，全靠团队协作，全靠推理。现实是现实中发生杀人命案，柯南的父亲工藤优作在现实世界中推理出了凶手，让凶手伏法。里面也有不少高光场面。尤其是小兰的自我牺牲精神，堪称经典。
2、通向天国的倒计时
黑衣组织第一次在剧场版出场。剧情、人设、推理、气氛都达到了完美。里面有很多高光场面。小兰前期勇敢的带着柯南跳楼，充分发挥自己的作用，而不像后面的毫无性格、只会叫新一，等着人来救的那个小兰。这个小兰人设很饱满,是我们心目中勇敢坚强的小兰。
3、世纪末的魔术师
20世纪最后一部剧场版。也是怪盗基德第一次出现在柯南剧场版中。一开始看到标题魔术师以为是怪盗基德，实际上这个“世纪末的魔术师”指的是那个贯穿全片的蛋的设计者喜一先生，里面的机关设计真的让人叹为观止。整个剧情逻辑缜密，毫不拖沓。案件贯穿始终。最让人想不到的专门射人右眼的杀人狂魔史考兵，竟然是一个漂亮的长腿美女。这也让人意想不到。
4、瞳孔中的暗杀者
这一部剧场版是围绕警察的杀人事件。虽然两个警察死的时候都手握警察手册，但是凶手真的超级难猜。说是史上最难猜的凶手都不为过。凶手完全是一个表现的人畜无害的、戏份不多的几乎一闪而过的人。也是各种经典台词的出处，这糖甜的不要不要的。
5、迷宫的十字路口
这一部剧场版讲的是服部平次和远山和叶的爱情，是讲爱情的剧场版，而且这部剧场版是唯一一部全程没有爆炸元素的剧场版。以服部平次的初恋为切入点，穿插着杀人事件，犯罪活动。最后找回佛寺丢失的佛像。不仅推理精彩，还很浪漫唯美，同时这部剧场版还讲了不少日本特色文化历史。
6、侦探们的镇魂歌
一个残废想找人帮自己调查真相。却采取非常极端的方式，给每个人手腕上都绑上炸弹手表。限时破案，不然就死。原来这个做事极端的残疾人之前也是一个犯罪分子。也不是啥好人，所以，才能做出这种极端的举动。这部剧场版聚集着毛利小五郎、柯南、服部平次、白马探（基德便装）的四位侦探。
7、引爆摩天楼
这部电影也开启了剧场版的爆炸先河。结局新兰的感情线也非常感人，糖也非常的甜。在红线和蓝线的抉择中，小兰选择了蓝线，救了一整个大楼的人。原因是：“因为不想剪断我跟新一之间的那根红线啊。”
8、第十四个目标
这部剧场版是98年的，是第二部剧场版。柯南早期的剧场版质量都非常的高，这部也不例外。毛利小五郎身边的人，目暮警官、妃英理、阿笠博士相继遭人暗算，而且这些人都和毛利小五郎有关。
经过线索搜集发现，这个凶手是按照扑克牌从黑桃K到黑桃1的顺序进行行凶的。并且其中第14个目标也是是指扑克牌第14张joker牌，是凶手最终的王牌，是指复仇完成后将会嫁祸给最终的那个人。
这部颇有点阿加莎克里斯蒂《ABC谋杀案》的味道。最后凶手是个品酒师。由于一场事故让他的味觉失灵，他就要动手杀掉所有羞辱自己甚至让自己味觉失灵的人。同时这部里还有毛利兰解开多年的心结，毛利小五郎为什么会对着被当成人质的自己母亲开枪，原因是当人质受伤的时候，这个人质对凶手而言已经无用了。
9、水平线上的阴谋
柯南为数不多推理错误的一部。其实这一部是毛利小五郎的高光剧场版。沉睡小五郎不沉睡，醒着一鸣惊人。而且里面涉及到毛利小五郎和妃英理的故事，比较感人。其实电影的立意很不错，小五郎看到一个女的很像妃英理，于是搜集各种证据想要证明他清白，结果最后推出她就是凶手。
10、银翼的魔术师
怪盗基德是《名侦探柯南》里的常客，剧场版里也经常登场。喜欢怪盗基德的这部一定不能错过。这部的剧情相对连贯，人物的塑造比较不错，解谜的部分较少，推理成份相对弱一些。迫降飞机很有大片的感觉。迫降飞机之前，小兰向工藤新一深情告白也很有看点。