南岭镇的历史可以追溯到遥远的古代。在唐朝和宋朝时期，它被划分为感德乡的方成里和新安里两个行政区域。清朝时期，南岭归属海口镇管辖。到了民国时期，它又隶属于海口区。1950年，南岭被划归为第二区，随后在1955年的行政区划变动中，它先后归属城头区和海口公社。1981年，南岭经历了一次重要的组织变革，成立了南岭人民公社。1984年，这个公社进行了改制，变为乡级行政区。最后，在1999年，南岭乡正式升级为南岭镇，标志着其在行政体系中的地位得到了提升。
南岭镇位于福清市东北部山区，平均海拔345米。1999年撤乡建镇。面积34平方千米，人口7073人（2004年）。辖8个行政村，29个自然村。