宠物小精灵中小智在第一部到第四部总共收复了22只宠物，分别是：
皮卡丘，小智最初的伙伴，具有顽强的性格，不愿意进入神奇宝贝球，起初与小智并不友好，在与烈雀的战斗中和小智建立了坚不可摧的友情。
比比鸟 ，在EP003中，小智收服的第二只神奇宝贝，在关东地区的旅行中，比比鸟参加了一系列的道馆和联盟的比赛。
绿毛虫，在EP003时，小智第一个收服的神奇宝贝。它喜欢小霞，但小霞却讨厌虫。
妙蛙种子，小智在EP010中得到的神奇宝贝，在不思议花园中，妙蛙种子拒绝了进化。在EP226中，妙蛙种子回到了真新镇。
小火龙 ，小火龙本是被另一位训练家抛弃的神奇宝贝，EP011中小智在雨中搭救使得小火龙最终加入了小智的队伍，在 EP042中打败椰蛋树军团后进化为火恐龙。
杰尼龟，它本是在枯叶市附近制造麻烦的杰尼龟军团之首，在EP012中被小智收服。杰尼龟之前，杰尼龟消防队曾经制造过许多麻烦；后来回到了君莎带领的杰尼龟消防队。
大钳蟹，小智在EP013收服的第七只神奇宝贝，个头要比小茂的大钳蟹小得多。在EP076中因打倒多武的椰蛋树进化成为巨钳蟹。
鬼斯通，EP023中，小智为了再次挑战金黄道馆，来到了紫苑镇的神奇宝贝塔，在和小智玩耍一会儿后，它同意与娜姿的勇吉拉战斗。
火爆猴，EP025，小智遇到它还是一只猴怪，为了追回帽子，小智与它战斗，并收服了它。火爆猴起初并不听从小智的命令。
臭臭泥，在EP030之前是破坏发电厂的臭泥首领。小智收服它后，经常和大木博士黏在一起。
肯泰罗(30只)，在EP035中野生原野区收服的神奇宝贝，喜欢快速奔跑。参加过橘子联盟、城都联盟与对战开拓区的比赛。
乘龙，EP085中，小智为了拯救它并使他和家人团聚而收服了它。乘龙帮助小智一行人在橘子群岛间旅行，并参加了道馆赛和橘子联盟胜利者杯的比赛。
卡比兽，小智在EP095中收服的大胃王，在橘子联盟决赛之前，小智将它留在了大木研究所。
赫拉克罗斯，小智在EP120收服的神奇宝贝，喜欢吸食树枝，多次参加道馆赛和联盟比赛。
菊草叶，在EP127小智收服的神奇宝贝，它喜欢小智，并妒忌皮卡丘总是能够生活在神奇表神奇宝贝球以外。
火球鼠，在EP142中与另一名训练家比赛后，小智收服的火球鼠。刚开始的时候，火球鼠的火焰技能锻炼地并不好。
小锯鳄，在EP152中，小智与小霞同时扔出了诱饵球收服了一只小锯鳄，小智通过神奇宝贝战斗战胜小霞得到了小锯鳄。
猫头夜鹰，在EP155中收服的神奇宝贝，具有异样的颜色，是一只闪光神奇宝贝。
大针蜂，EP162中，小智参加了自然公园捕虫大会收服的神奇宝贝，捕虫大会结束后，小智将它送给了奈奈。
金鱼王，在EP169小智参加金鱼王钓鱼战斗中临时拥有。
小小象，在EP229的神奇宝贝劲速赛获得优胜后，小智得到了小小象的蛋，它十分喜欢玩耍。
由基拉，原来是盗猎者偷走的神奇宝贝蛋，小智在EP259中得到了这颗神奇宝贝蛋，孵化成由基拉后，它十分惧怕人类。