主要区别有以下四个方面：
一、投资标的不同。
债券基金主要投资标的为债券，包括国债、企业债、金融债和可转债等等。当然，对于偏债型基金也持有少量的股票，但一般不会超过20%。
股票型基金主要投资标的为股票，少量资金会配置短期货币工具，以调整仓位和以备人们赎回之用。
货币基金主要投资标的为短期货币工具。当然，这里的短期货币工具包括有债券，比如国债和企业债等。但其投资的债券有比较严格的规范，比如最长剩余期限不能超过397天，且
信用等级不能低于AAA级等。不同于债券基金投资的债券，投资没有较为严格的规范。
二、收益的稳定性不同。
货币基金、债券基金和
股票基金，这三类基金相对比，收益的稳定性从高到低分别是：货币基金-债券基金-股票基金。
货币基金的收益率随市场利率波动而波动，相对稳定，且出现亏损的可能性极低。而债券基金采用净值法计算每日
单位净值，也就是说在短期之内，有极大可能出现亏损。
股票型基金：
股票市场的波动性极大，收益极不稳定。
三、风险性不同
这三类基金风险从低到高分别是：货币基金-债券基金-股票基金，基金的风险性取决于它自身的投资标的。
显然，货币基金投资的短期货币工具风险性最低。其次是债券基金，因为投资标的为债券，到期要还本付息，收益较为稳定。而股票基金随股票市场波动而波动，风险性极大，随时都可能出现亏损。
四、收取费用不一致
具体需参考基金公司给出的费率。