蜜蜂病虫害的种类较多。归纳起来有由生物因子和非生物因子引起的传染性病虫害和非传染性病虫害。传染性病虫害又根据侵染方式的不同，分为由致病微生物引起的侵染性病虫害和由寄生虫引起的侵袭性病虫害。
蜜蜂传染性病虫害主要有：
（1）病毒病。
主要有囊状幼虫病、麻痹病、蜂蛹病、云翅病毒病、埃及蜜蜂病毒病等。
（2）细菌病。
主要有美洲幼虫腐臭病、欧洲幼虫腐臭病、败血病以及副伤寒病等。
（3）螺原体病。
主要有蜜蜂螺原体病。
（4）真菌病。
主要有白垩病、黄曲霉病以及蜂王卵巢黑变病等。
（5）原生动物病。
主要有蜜蜂孢子虫病、蜜蜂阿米巴病等。
（6）寄生螨。
主要有雅氏瓦螨（大蜂螨）、亮热厉螨（小蜂螨）以及武氏蜂盾螨（气管螨）等。
（7）寄生性昆虫和线虫。
主要有蜂麻蝇、驼背蝇、芫菁、圆头蝇、蜂虱以及线虫等。
蜜蜂非传染性病虫害主要有卷翅病、冻伤幼虫、卵干枯病、枣花病、茶花中毒、甘露蜜中毒以及花粉、花蜜及农药中毒等。
此外，根据患病蜜蜂的虫态，蜜蜂病虫害主要有蜂卵病、幼虫病、蜂蛹病以及成年蜂病。