因为一些特殊选的原因，有三个皇帝没有入了明十三陵，他们分别是明太祖朱元璋、建文帝朱允炆、明景帝朱祁钰。他们都什么原因而没有入陵呢？
明孝陵修建用了25年，先后调动能工巧匠10万余人，规模庞大，占地170余万平方米。不光是朱元璋以后的历代明朝皇帝沿用明孝陵的规制和模式营建陵寝，就连清朝皇帝在修建陵墓时也进行了参照，因此明孝陵又被称为“明清皇家第一陵”。
首先，明太祖朱元璋是明朝的开国皇帝。1398年（洪武三十一年）6月24日，朱元璋病逝于南京，享年71岁。那时候，明十三陵还没开始修建，北京还是燕王朱棣的封地，朱元璋不可能埋葬在儿子的封地上。最终，朱元璋葬入位于南京紫金山上的明孝陵。
朱允炆是明朝的第二个皇帝，他是朱元璋的孙子。由于被立为皇太子的父亲朱标英年早逝，幸运地成为了朱元璋的继承人。然而，1298年朱允炆称帝后，由于与亲信大臣齐泰、黄子澄等采取一系列削藩措施，限制和削弱藩王的权力，引起了燕王朱棣等人的强烈不满。第二年，燕王朱棣从北京起兵，挥师南下，发起“靖难之役”。朱棣攻破了南京。在混战之中，皇宫起火。当大火被扑灭后，而朱允炆却消失不见了！
明景帝朱祁钰葬入景泰陵。朱祁钰是明朝的第七个皇帝。他哥哥明英宗朱祁镇御驾亲征，抗击瓦剌，结果在“土木堡之变”中兵败被俘。国不可一日无君，朱祁钰被推到前台当了皇帝。后来朱祁镇就被瓦剌放回来。然而，在1457年，朱祁镇在石亨、徐有贞等大臣的支持下，发动“夺门之变”，夺回了皇帝位置。朱祁镇将其以亲王的规格埋葬在北京西山景泰陵，而不是葬入明十三陵。
所以明朝16个皇帝只有13个在昌平十三陵陵区。长陵作为十三陵的第一座陵墓，之后的所有继承者都是朱棣的子孙。
1368年正月初四，朱元璋在应天府（今南京）建立大明王朝。1644年，李自成攻占北京城，崇祯皇帝在眉山上吊自杀，明朝被正式推翻。明朝276年共有16位皇帝。明朝皇帝大多葬在北京昌平区天寿山脚下，被称为明十三陵。顾名思义，明十三陵共有13座帝陵。
那么，哪三位皇帝没有葬在明十三陵呢？他们是朱元璋皇帝、建文皇帝朱云伟皇帝和景朱启裕皇帝。明代太祖朱元璋葬在南京明孝陵。朱元璋是明朝的开国皇帝。1398年6月24日（洪武31日），朱元璋因病在南京逝世，享年71岁。当时，明十三陵还没有开始修建。北京仍然是燕王朱棣的飞地。朱元璋不能葬在他儿子的飞地里。最后，朱元璋被埋在南京紫金山明孝陵。
明孝陵花了25年时间建成。先后动员了10万余名熟练工匠。占地面积170多万平方米。朱元璋之后的明朝皇帝不仅遵循明孝陵的建陵规则和模式，而且清皇帝也借鉴了明孝陵的建陵模式。因此，明孝陵又被称为“明清第一皇陵”。
建文皇帝朱云章：神秘失踪没有陵墓。朱云章是明朝的第二位皇帝。他是朱元璋的孙子。王储的父亲朱彪英英年早逝，幸运地成为朱元璋的继承人。然而，朱云章在1298年登基后，由于与其臣齐泰、黄自成等采取了一系列限制和削弱藩王势力的措施，引起了燕王、朱鼎等人的强烈不满。