在探讨超文学研究与跨学科研究之间的区别时，我们首先需要明确什么是跨学科研究。通常，跨学科研究被定义为涉及文学与其他艺术领域、社会科学与人文科学、以及文学与自然科学之间关系的研究。它并非文学研究的特有方法，而是科学研究中普遍采用的手段，如自然科学中的物理化学和生物医学等学科的发展，都是跨学科研究的体现。
要澄清的两个问题是：一，跨学科研究是否是所有科学研究通用的方法，还是仅限于文学研究？答案是，跨学科研究是普遍的方法，适用于各种学科，包括文学。例如，恩格斯对巴尔扎克作品的评价，涉及经济学、统计学、社会学和历史学等多个学科，这就说明文学研究常常需要跨学科视角。
其次，是否只有比较文学研究才使用跨学科方法？答案是否定的，因为文学本质上是人文学科，研究文学必然涉及多个相关领域。以《红楼梦》为例，从叔本华哲学、历史考据学、马克思主义阶级分析，到宗教学、精神分析学、性学、医学、政治学、经济学和语言学等多个角度的研究，都表明文学研究经常是跨学科的。
因此，尽管文学研究经常涉及跨学科，但我们不能简单地将所有跨学科的研究归为比较文学。实际上，大部分文学评论和研究论著都是跨学科的，这是从“多角度、多层次、全方位”研究文学现象的必然结果，强调的是广阔视野，而非局限在单一学科视角。所以，超文学研究与跨学科研究的区别在于，前者可能更加广泛和深入，而后者是研究方法的一种普遍应用。
我们所说的“超文学”研究方法，是指在文学研究中，超越文学自身的范畴，以文学与相关知识领域的交叉处为切入点，来研究某种文学与外来文化之间的关系。它与比较文学的其它方法的区别，在于其它形式的比较文学是在文学范畴内进行，而“超文学研究”是文学与“外来文化”的关系的研究。