南京大学有2个校区，分别是鼓楼校区和仙林校区。
南京大学鼓楼校区地址：南京市鼓楼区汉口路22号。邮编：210093。南京大学鼓楼校区为南京大学三大校区之一，是全国重点文物保护单位金陵大学旧址所在地。1952年南京大学由四牌楼迁往鼓楼办学，鼓楼校区也成为南京大学主校区，直至南京大学仙林校区启用。
南京大学仙林校区地址：南京市栖霞区仙林大道163号。邮编：210023。校区建设得到大量社会捐赠，几乎每幢楼每个建设项目都有校友、政府援建。仙林校区于2009年9月投入使用，2012年成为南京大学主校区。2012年，国际小行星命名委员会批准国际编号为187707的小行星正式命名为“南大仙林星”。
院系设置：
文学院
外国语学院
哲学系（宗教学系）
历史学系
物理学院
法学院
生命科学学院
政府管理学院
数学系
天文与空间科学学院
地球科学与工程学院
马克思主义学院
信息管理学院
社会学院
大气科学学院
地理与海洋科学学院
河仁社会慈善学院
化学化工学院
环境学院
医学院
软件学院
工程管理学院
计算机科学与技术系
电子科学与工程学院
匡亚明学院（基础学科教育学院）
大学外语部
体育部
现代工程与应用科学学院
建筑与城市规划学院
海外教育学院
新闻传播学院
创新创业学院
商学院
金陵学院
管理学院
南京大学简介：
南京大学坐落于钟灵毓秀、虎踞龙蟠的金陵古都，是一所历史悠久、声誉卓著的百年名校。其前身是创建于1902年的三江师范学堂，此后历经两江师范学堂、南京高等师范学校、国立东南大学、第四中山大学、国立中央大学、国立南京大学等历史时期，于1950年更名为南京大学。在一个多世纪的办学历程中，南京大学及其前身与时代同呼吸、与民族共命运，谋国家之强盛、求科学之进步，为国家的富强和民族的振兴做出了重要的贡献。尤其是改革开放以来，作为教育部直属的重点综合性大学，南京大学又在崭新的历史机遇中焕发出新的生机，在教学、科研和社会服务等各个领域保持良好的发展态势，各项办学指标和综合实力均位居全国高校前列。