一、性质不同
1、隐性基因：一种等位基因，只有该基因是纯合时，其决定的性状才会表达出来。
2、显性基因：无论该基因是纯合的还是杂合的，它都会被表达出来。
二、与遗传的关系不同
1、隐性基因：纯合子的基因要么是双显性要么是双隐性。如果显性用大写字母表示，隐性用小写字母表示，AA组合的纯合子为显性纯合子，aa组合的纯合子为隐性纯合子，而一个大写和一个小写组合的Aa就是杂合子。杂合子表现出由显性基因决定的性状，这是显性基因的“优先权”。
2、显性基因：显性基因控制显性性状的等位基因。在二倍体生物中，在杂合子状态下可以表现为表型的基因称为显性基因。显性基因往往形成功能物质（如酶），而显性基因的隐性等位基因由于相应核苷酸的突变而不能产生这种物质，因此只有杂合子中的显性基因才能发挥正常功能（显性）。
扩展资料：
显性基因用大写字母表示。例如（Xx）：这里X代表显性野生型等位基因，而x代表隐性突变体等位基因。
1、（XX）：纯合显性（X表型-野生型）
2、（Xx）：杂合（X表型-野生型。显性等位基因掩盖了隐性等位基因的表达）。
3、（xx）：纯合隐性（x表型-突变体表型）
参考资料来源：百度百科-隐性基因
参考资料来源：百度百科-显性基因
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