二者性质不同，没有可比性。
清华北大是公认的内地全日制教育里面最好的大学，中国科学院大学是研究院里面师资雄厚的大学。
清华大学、北京大学等很多名牌大学的本科生毕业之后也有不少进入中科院的各个研究所的。准确的说，它是一所研究生院，但是各个研究所的实力差距也很大，对人才的要求不一样。有重点高校考入中科院大学的也有非重点大学的学生进入中科院大学的，其实就是研究所的集合。
中科院主要介绍
中国科学技术大学位于安徽合肥，由“中国科学院的附设高校”这一概念成立于1958年，院校建设层次则是“双一流”、“985”、“211”建设院校。
中科院主要研究数学物理生物化学天文学等方向，因为是个大集合，里面自然拥有全国最多的院士。其中博士生的比例就高达到51%。这个不是一般性的全日制大学可以比的。准确来说，它不能算是一所全日制教育行的大学，而应该算是研究院校。
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