1、日本研究生留学学费
(1)大学院(研究生院)：日本国立大学院，约75.5万日元;
(2)日本公立大学院(平均)约82万日元;
(3)日本私立大学院：
人文科学，约101万日元;
社会科学，约103万日元;
医、牙学，约109万日元;
农学、药学，约115万日元。
2、日本研究生留学学杂费
一般情况下，报名费9800日元、入学金84600日元、研究料(学费)35万日元/年，共计约44万日元。
3、日本研究生留学医疗费
学生在日本留学一年以上必须入国民健康保险，缴纳额度是按照收入水平不同而缴纳。留学生一般视为无收入群体，缴纳最低额度的保险费(约2000日元左右)，看病时只需个人负担30%的医药费用。
4、日本研究生留学住宿费
日本国立大学一般设有国际交流会馆，租金低廉，多在5900～10000日元之间，因申请者多，不能保证赴日后立即入住;但可申请民间留学生宿舍，租金多在2～5万日元之间。
此为一般情况，随汇率、宿舍种类有所不同。
5、日本研究生留学交通费
(1)东京地铁：
成人单程票价种类有：160日元(起步价1-6公里内)、190日元、230日元、270日元和300日元;
儿童单程票价种类有：80日元、100日元、120日元、140日元、150日元。按乘坐距离购买。
(2)火车(东京内的JR火车的山手线yamanoteline)：130-210日元
(3)新干线火车(bullettrains)：
东京到大阪(tokyo-osaka)：13750日元(单程普通车厢);
东京到仙台(tokyo-sendai)：10590日元(单程普通车厢);
东京到广岛(tokyo-hiroshima)：18050日元(单程普通车厢)
(4)巴士：成人200日元的士：起步价(2公里内)650日元。日本留学期内，建议最好买月票。