第1章，深入剖析生物礁的基本特性，介绍了其独特的特征和主要类型，从现代的地理分布探讨其成因，以及古代的资源价值。第2章聚焦我国的生物礁研究，概述了研究概况，并详细解读了我国生物礁的群落和生态特性。
第3章，深入研究生物礁的发育与环境关系，解析现代珊瑚礁发育所需的环境条件，以及它们如何影响海洋环境。第4章关注生物礁群落的演化历程，从现代珊瑚礁群落的构成，到时间演替序列和多样性变化，以及造礁生物门类的演变历程。
第5章，现代珊瑚礁生态系统的深入探究，包括生态系统研究、特征分析，以及太平洋东部的独特生态系统实例。第6章回顾生物礁生态系统的历史演化，从前寒武纪的叠层石礁到新生代的现代化，揭示其在全球环境变化中的重要地位。
第7章，生物礁作为古环境的重要标志，通过研究其演化，解读全球变化的历史。同时，通过加拿大生物礁的实例，探讨其时代和古环境的关联。第8章关注现代珊瑚礁的保护和可持续发展，讨论人类活动和自然因素对珊瑚礁的威胁，以及如何实现其可持续利用。