自动用人单位应当结清工资，但劳动者应当赔偿损失，用人单位不结算工资可向劳动监察投诉，也可以申请劳动争议仲裁。自动离职，指劳动者根据用人单位和自身情况擅自离职，而强行解除与用人单位的劳动关系的一种行为。因辞职或要求解除合同未准，擅自离职或违约出走;未说明原因不辞而别;受优厚待遇诱惑擅自“跳槽”等均属自动离职。
1、协商解决。2、到劳动行政部门举报。公司不按时支付员工工资的，员工可以随时解除劳动合同，并立即要求公司支付员工拖欠的工资以及按照拖欠工资的支付25%的经济补偿金。3、也可以直接申请仲裁。首先，要确认和单位之间的劳动关系的事实。其次，确认劳动关系后，可以要求单位补缴社会保险，补发工资。
工资，是指用人单位依据劳动合同的规定，以各种形式支付给劳动者的工资报酬。劳动者付出了劳动，用人单位即应按照合同约定的标准支付报酬。根据劳动部《工资支付暂行规定》第九条规定，无论是解除合同是否合法，用人单位均应在解除合同之时一次性结清工资。
赔偿损失与结清工资是不同的法律关系，二者应当分别计算，合并结算。用人单位不进行工资结算的，劳动者可以向劳动监察投诉，也可以申请劳动争议仲裁。
【法律依据】：《劳动合同法》第九十条
劳动部《关于实行劳动合同制度若干问题的通知》(劳部发〔1996〕354号)第18条规定，因此对用人单位造成损失的，应当承担赔偿责任。用人单位要求劳动者赔偿损失的，应当承担举证责任。
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