努尔哈赤兴起后，对蒙古采取了既不同于中原汉族皇帝、也不同于金代女真皇帝的做法。他用编旗、联姻、会盟、封赏、围猎、赈济、朝觐（jìn）、重教等政策，加强对蒙古上层人物及部民的联系与辖治。后漠南蒙古编入八旗，成为其军政的重要支柱；喀尔喀蒙古实行旗盟制；厄鲁特蒙古实行外扎萨克制。
仅以和亲为例：据秦永洲和华立的统计，自天命初到乾隆末下嫁到外藩蒙古的，“从公主到乡君就有70余人之多。见诸《外藩蒙古回部王公表传》的额驸有69人，八旗中的尚不在内”；“嘉道年间，科尔沁、敖汉、巴林部共公主子孙、台吉、姻亲3000余人。自天命初到乾隆末下嫁到外藩蒙古的公主、格格共有公主22人、郡主21人、县主6人、郡君9人、县君7人、乡君6人。据道光年间的统计，当时科尔沁达尔汉王旗下有公主子孙台吉、姻亲台吉共2000人，土谢图王旗下公主子孙台吉500余人，敖汉旗下有600余人，巴林旗下有170余人。