1到4级主任科员和一、二级科员全是国家公务员的职务级别，虽说他们门命名全是科员结束，但把他们说成科员并不是完全正确的，他们是有相应的区别的。区别是层级和待遇有所不同。
一、二级科员可以总称为科员，他们全是科员级。在其中二级科员是较低等的职务级别，等同于之前的办事员，一级科员则等同于之前的科员。要提升一级科员，必须任二级科员满2年。是因为这类提升没有编制数的限定，只需要工作可以担任，年终考核都是在合格以上，通常实现年数就可以提升。
1到4级主任科员是不可以称作科员的，他们应属科级，在职务级别层级上高一科员级。在其中一、2级主任科员应属正科级，三、4级主任科员应属副科级。为了能简单明了的表达出他们两者之间的区别，通常把1级主任科员称之为“大正科”，2级主任科员称之为“小正科”，3级主任科员称之为“大副科”，4级主任科员称之为“大副科”。
1到4级主任科员必须逐层提升。在其中提升4级主任科员必须任一级科员2年以上；提升3级主任科员必须任4级主任科员2年以上；提升2级主任科员必须任3级主任科员2年以上；提升1级主任科员必须任2级主任科员2年以上。但这与科员级的提升不一样，通常难以实现就职年数就提升，是因为有编制数的限定，尤其是地市级以下机关单位，1到4级主任科员不可以超出机关单位综合管理类国家公务员的60%。
1到4级主任科员和一、二级科员不全是科员，仅有一、二级科员是科员级，而一至4级主任科员是科级，二者层级不一样，享有的工资待遇也并不相同。
一至四级主任科员是不能称之为科员的，他们属于科级，在职级层次上高一科员级。其中一、二级主任科员属于正科级，三、四级主任科员属于副科级。为了简洁明了的表述出他们之间的区别，通常把一级主任科员称为“大正科”，二级主任科员称为“小正科”，三级主任科员称为“大副科”，四级主任科员称为“大副科”。
一至四级主任科员需要逐级晋升。其中晋升四级主任科员需要任一级科员两年以上；晋升三级主任科员需要任四级主任科员两年以上；晋升二级主任科员需要任三级主任科员两年以上；晋升一级主任科员需要任二级主任科员两年以上。但这与科员级的晋升不同，一般很难达到任职年限就晋升，因为有职数的限制，特别是市级以下机关，一至四级主任科员不能超过机关综合管理类公务员的60%。
综上所述，一至四级主任科员和一、二级科员不都是科员，只有一、二级科员是科员级，而一至四级主任科员是科级，两者层次不同，享受的工资待遇也不相同。