一、手机的外形尺寸不同
iPhone 6s Plus手机的外形尺寸为158.2x77.9x7.3mm；iPhone 6 Plus手机的外形尺寸为158.1×77.8×7.1mm。
二、手机的外观颜色不同
iPhone 6s Plus手机的外观颜色有金色，玫瑰金色，银色，深空灰色；iPhone 6 Plus手机的外观颜色有深空灰色，银色，金色。
三、手机摄像头的像素不同
iPhone 6 Plus手机后置摄像头的像素为800万像素，FaceTime高清摄像头为120万像素；iPhone 6s Plus后置摄像头的像素为1200万像素，FaceTime高清摄像头为500万像素。
参考资料来源：百度百科-iPhone 6s Plus
参考资料来源：百度百科-iPhone 6 Plus
首先一点就是“s”，不只是名字而已。这次苹果直接给iPhone6s/6s Plus的后盖下方添加了一个“s”标识，所以除了玫瑰金版之外的其他版本上如果看到这点，就基本可以知道其不是iPhone6/6 Plus而是iPhone6s/6s Plus了。
除此之外，还有一个小小细节在摄像头部分。iPhone6s/6s Plus的摄像头蓝宝石镜片内层变得更黑了一些，非常细微的变化，算是在设计美观度上的一点精益求精的改善，当然也有可能是工艺差异间接导致的不同。无论如何，可以将其作为辨别“s”的细节之一。
除此之外，iPhone6s/6s Plus的机身尺寸相比iPhone6/6 Plus也发生了细微的变化，但除了看苹果公布的数据，我们实际上几乎察觉不出来，基本只有0.1-0.2毫米的差异而已，微乎其微。究其原因，主要在于屏幕添加了3D Touch压感触控功能支持、同时机身由6000系列铝合金换成了7000系列铝合金两个方面——而这也同时导致了iPhone6s/6s Plus的机身重量比之前更重，这里能够感受得更明显一些，会比iPhone6/6 Plus更有压手感。携带起来，iPhone6s还好，iPhone6s Plus因为更大更重所以会稍感不便。
这次苹果iPhone6s机身采用了更加坚固的7000系列铝合金，而之前为6000系列。其实这并非苹果第一次采用7000系列铝合金，之前已经在Apple Watch Sport上首次采用。该系列的特点是更坚硬，相比之前强60%，同时其具有更高的纯度。当然，我们也不能就此理解为7000系列就比之前的6000系列强，算是各有特点，而基于苹果iPhone对机身硬度的需求增加，所以目前7000系列成为了一种更合适的解决方案。所以理论上说，“弯弯门”在iPhone6s上出现的几率比之前更低了。当然是不是还会有，现在还很难说。
苹果首次为iPhone增加了3D Touch压感触控功能，个人认为，这才是最革命性的升级，从此将有可能是手机从键盘到触控操作后的一次新的操作革命，把二维操作升级到了三维，以后不再只是基于平面的滑屏，竖向按压屏幕成新重点，平面+竖向，操作变立体。当然，相比横向滑屏，纵向按压“键程”确实有限，但这也足以革新当前智能手机的触屏操作体验。从iPhone6s/6s Plus的3D触控应用中就可以感受明显。
如苹果iPhone6一样，iPhone6s同样采用了4.7英寸1334*750像素的屏幕，屏幕像素密度保持在326ppi的水平上;iPhone6s Plus依然是1920*1080像素，401ppi不变。并且二者依然是2.5D边缘，使其整体圆润度极高。
苹果iPhone6s在屏幕上的最大升级是加入了压力感应触控，使触屏手机的操作性进一步扩展。苹果最早在12英寸的Macbook的触控板当中加入压感触控，之后也运用在了Apple Watch的屏幕上，名为“Forch Touch”。此次是首次将压感触控体验加入到苹果iPhone手机当中。但在iPhone6s/6s Plus上苹果为其起了个新的名字“3D Touch”，一方面更容易理解，另一方面，3D Touch也在之前Force Touch的基础上进行了小小升级，即增加了重按(Pop)支持。
可以说，3D Touch是一个非常惊艳的功能，直接改变了iPhone的操作体验，基本是重新定义了触控屏幕的操作方式，使原有更平面的操作变得更立体了起来。我们这里暂且简单归纳几点3D Touch为iPhone6s/6s Plus带来的全新操作——
收发邮件：重力按压点击就能看到邮件内部内容，不用打开。
信息当中：按压就能看到日历、航班信息、链接预览，不用转换应用或点开链接;
按压单个应用直接显示预览，比如音乐、照片;
地图中按压能够看到具体地点的预览信息;
滑动轻松切换应用;
游戏：长压、短压，拉近拉远距离，释放技能等;
Live Photos(实时照片、动态照片)：按压照片画面可以预览动态效果、甚至听到音量。该功能可以在Apple Watch、iPhone和iPad等各种设备上使用——不过此功能会导致拍照的同时生成一个短视频，对机身存储带来一定的压力，可想而知，16GB版本就更加拥挤了——所以在不用时可以将其在拍照界面关闭以节省流量(见后文详细介绍);
本回答被提问者和网友采纳在外观方面，下一代iPhone还将维持现阶段iPhon6系列的屏幕尺寸——4.7英寸和5.5英寸，分辨率也不会改变，至于4英寸的iPhone产品，暂时不会推出。此外，iPhone6s/6s Plus还将会在外壳结构和材质选择上做出调整，以增强机身强度。iPhone6s/6s Plus还将增加一款玫瑰金配色。
iPhone6s/6s Plus已经进入量产，2015年的出货量大约在 8,000万台至9,000万台，4.7英寸和5.5英寸两种机型出货比例2:1。
6s plus使用了A9芯片，比6 PLUS的A8芯片运算速度更快，图像处理器更优秀，能耗下降20%。然后6S PLUS具备3D touch，可以感知手指在屏幕上压力时时刻刻的变化，并给出游戏开发更多的可能，更多的操作模式。其余的，续航比iphone6好一些。总结一下6s plus就是更快更聪明更强。
iphone6s 的3D Touch出来以前， 按操作功能说 iphone和安卓系统手机在致相同。
单击： 打开
长按：管理和选择
现在的3D Touch： 可以理解成用电脑时的鼠标右键，多了许多快捷方式。这就相当于用户要3步或更多步操作 变成2步操作。便利性， 效率高了很多。要见实际操作图示：http://www.iznb.cn/article/17639?_s=1.0102
如果想用3D Touch的手机，也不一定是iphone, 未来安卓7.0也会有此技术。智能帮社区有持续关注。你可以去看看。