菽麻为豆科猪屎豆属一年生草本植物。
1.根
直根型，主根粗壮，入土深100～130cm。侧根较多，从地表以下10～15cm的主根膨大处呈现四、五纵列横向生长，分布较广。80%多的根集中在0～30cm的土层内。有根瘤，分圆形单瘤和薑瓣状复瘤两种，生长前期单瘤多，中、后期多为复瘤。
2.茎
茎直立，高2～2.5m，主茎表层由13条沟纹组成，全株密被绢质短柔毛。它具有多分枝习性，一般为3～4级分枝，多者可达5～6级，每级分枝由上向下逐个发生，稀播者分枝多，密播则分枝少。
3.叶
单叶，矩圆形或矩圆状披针形，长5～10cm，宽约1.5～2.5cm，两端渐狭，两面密被绢质短柔毛，托叶狭披针形。
4.花
总状花序顶生或腋生，花冠黄色，花序长40～60cm，每个花序有花11～12朵，花萼包住花瓣，萼5裂，萼长1.2～2cm，密被淡褐色绢质短柔毛。花内有雌蕊一个，由柱头和子房组成，在子房内有胚珠4～9个，雄蕊10个，5长5短包围在花柱的四周，长雄蕊比花柱低4～8mm，短雄蕊比花柱低9～10mm。
5.果实
荚果圆柱形，长约2～4cm，密被绢质短柔毛，未成熟时淡绿色，成熟时变浅黄色，内部光滑，每荚有种子6～15粒，一般为8～10粒；种子肾脏形，长、宽、厚分别为7.5、4、1.5mm左右，深褐色或绿褐色。千粒重一般为30～32g，最大的可达45g左右。
染色体2n=16。
菽麻