截止2019年4月，《圣斗士星矢》一共16部，其中剧场版5部。
1、银河战争篇
讲述故事发生的十三年前，一名黄金圣斗士艾俄洛斯抱着一个女婴跑出圣域，这女婴便是雅典娜。艾奥罗斯被杀，一切由此而起。主角星矢连同其馀青铜圣斗士为保护雅典娜而展开激战。
2、教皇刺客篇
讲述来自圣域的杀手杜拉狄斯突然出现，一辉为了大家的安全，使出凤翼天翔，杜拉狄斯、一辉与及黄金圣衣除头部外的其他部份，都消失于地裂之中。可是杜拉狄斯并没有死去，他来到城户家捉走了城户沙织，要胁众人要拿出黄金圣衣的头罩来交换。
3、黄道十二宫篇
讲述穿上了人马座黄金圣衣的星矢仍然不是艾奥里亚的敌手，幸得沙织以女神的身份出现，再加上艾奥罗斯的灵魂帮助星矢，艾奥里亚终于明白真相，返回圣域找亚历士算帐。到最后，米罗终于知道他们保护的乃是真正的雅典娜，所以点了冰河的真央点，恢愎冰河的五感。
4、北欧仙宫篇
讲述身为北欧亚斯格特之神奥汀的地上代行者希露达，受到黄金戒指魔力的影向，由以前善良的少女变成现在一心要占领圣域的邪恶女王。她唤醒了传说中的七个神斗士，并向圣域挑战。于是星矢他们再一次出发，远赴极北之地亚斯格特。
5、海皇神殿篇
讲述支配海界的海皇波士顿，为了要肃清大地，竟不断降下豪雨，希望能以大海啸、大洪水把人类淹灭，从而建立一个神的理想世界。他更把雅典娜掳去，要求一起统治新的世界，但为女神所拒绝。雅典娜为了延迟地上被海水淹没，自愿当上大黑柱的生祭品。
6、冥王十二宫篇
讲述在遥远的神话时代，冥王哈迪斯曾率领108冥斗士向人类世界发起攻击，智慧女神雅典娜则率圣斗士们奋起迎敌。连番苦战之后，哈迪斯及其军团战败，他们全部被雅典娜封印，而圣斗士也几乎损伤殆尽。数千年后，圣斗士刚刚结束与海王波塞冬的苦战。
7、冥王冥界篇
圣斗士星矢冥王篇讲述的是雅典娜的圣斗士与海皇一战后，与冥王哈迪斯进行新的战斗。冥王哈迪斯的真身便藏在此处，雅典娜也被困于此。
8、冥王极乐净土篇
讲述星矢等人在通过叹息之墙后，到达极乐净土的故事。极乐净土据说是只有生前心灵纯洁的人，在死后才能到达的地方。星矢等人将再次创造奇迹，救出雅典娜。
9、圣斗士星矢：黄金魂（外传）
讲述穿越悠远时光，为了守护地上的爱及和平，十二位黄金圣斗士再次复苏！于冥界与哈迪斯军的战役之中，十二位黄金圣斗士为助星矢一行人突破重围，不惜牺牲自我生命，以凿穿叹息之墙，诺大谜团尚未厘清，却又被卷入战争的艾奥里亚。
10、圣斗士星矢Ω（后传）
讲述从神话时代到现代，每当有邪恶出现之时，正义的希望斗士·圣斗士必然会挺身而出。他们身穿名叫圣衣，为女神雅典娜而战。其中，数次救下雅典娜的青铜圣斗士·天马座星矢等人的友情与战斗的事迹为传说写下新的篇章。
11、圣斗士星矢：邪神艾莉丝（剧场版）
讲述善良的孤儿院女老师绘梨衣与孩子们过着平静的生活，但是她受到黄金苹果的召唤，化身为纠纷女神爱丽丝。为了实现毁灭世界的目的，她绑架了女神雅典娜，并用金苹果将其捆住。随同纠纷女神一同复活的还有矢座魔矢、天琴座奥菲斯等五位亡灵圣斗士。
12、圣斗士星矢：神与神之激战（剧场版）
讲述遥远的东西伯利亚，正在此地修炼的冰河，偶然救助一个被人追杀的男子。从他的口中，冰河得知北欧的神之大陆发生巨大变故，神与神的战争一触即发。在此之后，冰河神秘失踪，纱织小姐带领星矢等人拜访了神之大陆的教主多路巴，然而对方却不理他，神域之行一无所获。
13、圣斗士星矢：真红少年传说（剧场版）
讲述过了数千年，太阳神再次复活，回到地上。他还主动地找雅典娜，要求她一起统治新的世界。这时，星矢等人来到找沙织，却被太阳神的日冕圣斗士所阻止，而且阿贝尔更以神力使到在十二宫中死去的黄金圣斗士复活。
14、圣斗士星矢：最终圣战的战士们（剧场版）
讲述四道邪恶光辉侵入圣域，以迅雷不及掩耳之势击毙守护圣域十二宫的黄金圣斗士。来者乃圣魔天使，是堕落天使路西法的手下。神话时代，路西法试图支配全宇宙并凌驾创世神之上，最终被打入魔界，他怀着恐惧罪恶的念头苏醒，企图支配全宇宙，全宇宙的命运危在旦夕。
15、圣斗士星矢：圣域传说（剧场版）
讲述射手座黄金圣斗士艾欧洛斯怀抱真正的女神转世雅典娜逃出圣域，途中遭到双子座撒卡和摩羯座修拉的阻击身负重伤。命运的趋势下，垂危一线的艾欧洛斯将女神托付给刚好来喜马拉雅山脉探险的日本城户财团总裁城户光政。
16、圣斗士星矢：天界篇序章（剧场版）
讲述讲述冥界之战后，星矢、沙织等人与天界之上的神祗月神阿尔忒弥斯及太阳神阿波罗战斗的故事。