中央银行的中间业务是不计入中央银行的负债业务和资产业务的其他业务，主要涉及清算业务。
清算业务是中央银行为商业银行和其他金融机构办理资金划拨清算和资金转移的业务，通过一定的方式和途径，使金融机构之间的债权债务清偿和资金转移顺利完成并维护支付系统的稳定运行，从而维持社会经济的健康发展。
清算业务是中央银行的一项传统业务，也是中央银行金融服务职能的具体反映。
中央银行的清算业务有三个方面的内容。
一是集中票据交换。
这项业务一般是通过中央银行组织票据交换所进行，但如果有些国家专门设置了票据交换所，形成的差额还是要通过中央银行转账。
二是集中清算交换差额。
各商业银行之间形成的清算差额可以通过其在中央银行设立的账户进行转账支付。
三是办理异地资金转移。
各城市、各地区不同的商业银行之间的资金划拨可以通过中央银行统一办理。