1995年，温州港的货物吞吐量达到了600.62万吨，旅客吞吐量为146.87万人次；外贸吞吐量为30.75万吨，国内集装箱为12011自然箱，国际集装箱则达到了19302TEU。这一年，温州港下属企业的货物吞吐量达到了267.63万吨。
随着发展，2000年，温州港的货物吞吐量大幅增长，达到了859.44万吨，相比于1995年增长了21.9%。接下来的几年里，吞吐量持续上升：2001年达到1314.3万吨，2002年增长到1650万吨，增长率为25.5%。到了2003年，货物吞吐量已经突破2338万吨，集装箱吞吐量更是达到了18万标箱。
2004年，温州港的货物吞吐量进一步提升至3440.51万吨，相比于2003年增长12.5%；集装箱吞吐量也达到213149TEU，同比增长17.7%。2005年，累计完成的货物吞吐量为801万吨，集装箱吞吐量为23万TEU，与上一年度相比均有增长。
2005年是一个重要里程碑，温州港的货物吞吐量首次超过3000万吨，达到了3097万吨，比2004年同期增长了17.76%，创造了历史最高纪录。接下来的2006年，吞吐量达到了3924万吨，2007年则有所下降，为1310万吨，而2008年，温州港货物吞吐量首次突破5000万吨，显示了强劲的增长势头。
温州港是一个千年之港。 据《温州港史》记载，早在战国时期，温州就出现了原始港口的雏形。唐代，中国商人开辟了日本值嘉岛直达温州的航线。清代长期“海禁”，温州港海上贸易受阻。公元1876年，《烟台条约》签订，温州被辟为通商口岸。孙中山《建国方略》中，指出温州应该建设一个东方大港。