1.周自齐（1871-1923），1911年2月至1912年1月出任清华学堂监督。
2.唐国安（1858-1913），1912年4月至1913年8月出任清华学校校长（1912年10月以前称监督）。
3.周诒春（1883-1958），1912年4月至1913年8月出任清华学校校长（1912年10月以前称监督）。
4.张煜全1918年4月至1920年1月出任清华学校校长。
5.金邦正（1886-1946）1920年8月至1922年4月出任清华学校校长。
6.曹云祥（1881-1937）1922年4月至1928年1月出任清华学校校长。
7.温应星（1877-？）1928年4月至1928年6月出任清华学校校长。
8.罗家伦（1897-1969）1928年8月至1930年5月出任国立清华大学校长。
9.吴南轩（1893-1980）1931年4月至1931年6月出任国立清华大学校长。
10.梅贻琦（1889-1962）1931年10月至1948年12月出任国立清华大学校长。
11.蒋南翔（1913-1988）1952年11月至1966年6月任清华大学校长。
12.刘达（1911-1994）1977年4月至1983年5月出任清华大学校长兼党委书记。
13.高景德（1922-1996）1983年5月至1988年10月出任清华大学校长。
14.张孝文（1935-）1988年10月至1994年1月出任清华大学校长。
15.王大中（1935-）1994年1月至2003年4月出任清华大学校长。
16.顾秉林（1945-）2003年4月至2012年1月出任清华大学校长。
17.陈吉宁（1964-）2012年1月至2015年3月出任清华大学校长。
18.邱勇（1964-）2015年3月至今出任清华大学校长。
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