法律分析：1、所缴纳的险种不同：城镇职工社保包含养老保险、医疗保险、工伤保险、生育保险、失业保险五个险种，单位职工所缴纳的社保就包含五险，而灵活就业人员自己缴纳社保，通常只能缴纳养老保险和医疗保险两个险种。
2、缴费强制性不同：对于企业职工来说，社保是强制缴纳的，单位和单位职工必须依法缴纳社保，而对于灵活就业人员来说，社保是自愿缴纳的，参保人员可以根据自身情况决定是否要缴纳社保。
3、缴费基数不同：企业职工社保缴费基数是根据参保职工本人的月均工资确定的（不能超过当地规定的上下限），参保职工不能自由选择，而灵活就业人员的缴费基数可以自己选择，一般是在当地上年度社会平均工资的60%-300%的范围内自由选择。
4、缴费比例不同：企业职工养老保险缴费比例分为单位缴费比例和个人缴费比例两个部分，目前单位缴费比例为16%，个人缴费比例为8%，企业职工医疗保险单位缴费比例为8%左右，个人缴费比例为2%左右；而灵活就业人员的养老保险缴费比例为20%左右，医疗保险比例可能有4%左右和8%左右两种选择，如果医疗保险缴费比例选择4%，那么通常就没有医疗保险个人账户，如果选择按8%的比例缴纳医疗保险，那么通常会有医保个人账户。
法律依据：《中华人民共和国社会保险法》
第二条 国家建立基本养老保险、基本医疗保险、工伤保险、失业保险、生育保险等社会保险制度,保障公民在年老、疾病、工伤、失业、生育等情况下依法从国家和社会获得物质帮助的权利。
第四条 中华人民共和国境内的用人单位和个人依法缴纳社会保险费，有权查询缴费记录、个人权益记录，要求社会保险经办机构提供社会保险咨询等相关服务。个人依法享受社会保险待遇，有权监督本单位为其缴费情况。
第五十八条 用人单位应当自用工之日起三十日内为其职工向社会保险经办机构申请办理社会保险登记。未办理社会保险登记的，由社会保险经办机构核定其应当缴纳的社会保险费。自愿参加社会保险的无雇工的个体工商户、未在用人单位参加社会保险的非全日制从业人员以及其他灵活就业人员，应当向社会保险经办机构申请办理社会保险登记。国家建立全国统一的个人社会保障号码。个人社会保障号码为公民身份号码。