（一）生育期：我国陆地棉种质资源的生育期（播种—吐絮期）差别很大，中国农业科学院棉花研究所安阳的试验结果，有长至163d的BJA592，有短至108d的中棉所27，相差55d，还有生育期104d的邯719。黄滋康、崔读昌（2002）根据≥10℃积温的多少及无霜期的长短，将我国的植棉区划分为特早熟、早熟、次早熟、中早熟、中熟、晚熟六大生态区，每个生态区品种的熟性还很不一致，这充分反映出我国棉花种质资源生育特性的多样性。各生态区在育种上都十分注意品种的早熟性，只有成熟早的品种，才能在有效结铃期内，多结棉铃并及时成熟。
（二）丰产性：产量是比较复杂的性状，构成产量的主要因素有单株结铃数、单铃籽棉重、衣分等。一般情况下，同一个品种的单株结铃数、单铃籽棉重较为稳定，所以棉花的丰产性与单株结铃数、单位面积的株数密切相关。增加单位面积的铃数是提高产量的关键性措施。丰产性较好的品种有鲁棉1号、泗棉3号、中棉所12等。
（三）抗病性：棉花常见的病害有立枯病、根腐病、枯萎病、黄萎病等。苗期对立枯病、根腐病等有较强抗性的品种有珂字棉100抗萎、罗登1066、登恩119等；在枯萎病重病区，植株生长正常，不受为害，产量高，品质好，表现明显抗枯萎病的品种有陕401、86-1、中棉所12、冀棉3118等；对黄萎病表现抗性的品种有辽棉7号、美8123、Arcot-1等。
（四）抗虫性：棉蚜、棉铃虫、棉红铃虫、棉叶螨是为害棉花的四大害虫。一些种质对这四大害虫表现出形态抗性或生理抗性，在棉蚜发生期间，叶片无受害（或受害最轻），耐苗蚜的品种有苏联B70系等，耐伏蚜的品种有Siokral22等；在棉铃虫发生期间，蕾铃和顶尖的受害百分率都较轻，耐棉铃虫的品种有运87-509等；长江流域棉区棉红铃虫发生较重，耐棉红铃虫的品种有斯字棉82591、Acaia1517-E、中5968等；棉叶螨为害期间，棉叶上红斑不明显的品种有选系1等。
（五）耐逆性：棉花生长期间，常遇到干旱、盐碱、湿、肥、寒等逆境，许多种质对这些逆境表现出较好的耐性。研究表明，雨量较少的黄河流域（含辽河流域）棉区的品种较之雨量较多的长江流域棉区的品种耐旱性好，根系发达，灌水后生长力恢复较强。耐旱的品种有辽棉5号、辽棉10号、晋棉6号、冀邯3号等；土壤含盐量在0.3%以上，棉苗生长受到明显抑制，对0.3%盐量较耐的品种有得州曼毛斯、红心半光籽等；在连续下雨，土壤的含水量一直处在饱和状态下，死苗（株）较少的为较耐湿品种，如湖北71101、盐棉48、鄂抗89-5231、苏联棉54系等；晚熟类和大铃类品种耐肥性较差，早熟、中早熟类品种耐肥性较强，在高肥力条件下能增产的品种有辽棉5号、鲁棉1号等；棉籽在9℃的低温条件下能发芽，棉株短时间能忍耐0℃低温，耐寒性较强的品种有辽棉1号、辽60277等。
（六）繁殖特性：棉花是常异花授粉作物，昆虫传粉引起的天然异交率较高，通常为5%，有时高达10%以上。为了确保种质原有的遗传特性及其遗传完整性，繁殖种质需在开花前采取套袋或开化前一天扎蕾的方法，让其严格自交，以避免生物学混杂。对于棉花种质繁殖圃，每份种质需要种植50～100株，同时要不断地鉴定品种及其纯度，其方法主要是依据各品种的特性，在不同生育时期调查生育期、果枝类型、叶形、叶色、叶蜜腺、植株色素、腺体、花冠颜色、花药颜色、花蕊颜色、铃形、棉絮颜色、种子绒毛的有无、短绒色等性状，与原始记载性状作对照，不符的植株拔除。