黄连根和根茎的形态与分布:黄连地上部除花薹叶,无直立茎,叶丛生在分支的地下根茎上,在根茎上又密生黄色的须根。黄连的地下根茎有结,但节间短。因此,根系属浅根系。此外,须根一般长20~30cm,密集于0~10cm的土层,其中0~5cm土层内占27%;而5~10cm的土层内占70%,但须根在土壤中分布较宽,一般是根长的2倍。黄连的根主要吸收0~10cm土层中的养分。因此,施底肥不宜过深,有的主产区不太重视基肥,以追肥为主。
此外,黄连喜肥沃的土壤,尤其是腐殖土,它不仅养分含量高,更重要的是保水、保肥性和土壤物理性状良好(如疏松、通透性等),有利于根系的生长发育。所以,培肥土壤在黄连的生产中有很重要的意义。