1、规定不同
复方药是指两种或两种以上的药物混合制剂，可以是中药、西药或中西药混合。单方就是一种药材、而复方就是两种以上的药材合用。
非处方药是指为方便公众用药，在保证用药安全的前提下，经国家卫生行政部门规定或审定后，不需要医师或其它医疗专业人员开写处方即可购买的药品，一般公众凭自我判断，按照药品标签及使用说明就可自行使用。
2、成分不同
复合是指由几种同类别的药物组成的制剂。这些药物可以看成是一个整体，同属一类，构成“复合”之意而得此名。例如，常用的复合维生素B，它是由维生素B1、B2、B6复合而成的，并以此为主，同时还含有烟酰胺、泛酸钙等，所以命名为“复合维生素B”。
非处方药由处方药转变而来，是经过长期应用、确认有疗效、质量稳定、非医疗专业人员也能安全使用的药物。不过在非处方药中，还有更细的分类，红底白字的是甲类，绿底白字的是乙类。甲乙两类OTC虽然都可以在药店购买，但乙类非处方药安全性更高。
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3、获得方式不同
与处方药相对，非处方药是消费者不需医生开处方即可自行购买使用的药品。
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