中山医科大学是一所多专业、多层次、多形式办学的综合性医科大学。除校本部外,尚有附属一院、附属二院、附属三院、眼科中心、肿瘤医院、整形医院、口腔医疗中心、深圳医疗中心、三个专科医院,一所中等卫生学校等附属单位。附属医机构现共有限额二千六百多张病床,年住院病人四万多人次,年门诊量约三百多万人次。
随着中国改革的浪潮,中山医科大学正在改革开放中前进。“面向现代化、面向世界、面向未来”教学,医疗和科研相结合努力多出人才,多出成果。截至2014年,学校共设有中山医学院、公共卫生学院、光华口腔医学院、护理学院和药学院 ,以及口腔系、法医系、护理系各种研究所、室三十八个,承担国家科研项目一百多项。设有七十三个教研室,设置基础医学、临床医学、预防医学、口腔医学、法医学、医学营学、护理学等七个专业。从一九八八年起,在临床医学专业试办七年制,实行“五七分流”学制的改革。现有权授予博士学位的学科、专业十八个,有权授予硕士的学位、专业三十一个,列为国家进修教育基地的学科和专业五十八个。