合肥工业大学土木学院在学科建设上涵盖了多个领域，致力于工程实际问题的理论研究与应用创新。
首先，工程结构力学分析方向重视力学在工程中的实践应用，研究大型和复杂工程结构的建模、数值模拟，如汽车、水坝和桥梁，同时涵盖振动与故障诊断、损伤、疲劳、可靠性分析以及结构分析软件与CAE技术。计算力学领域，有限元和边界元法的研究与工程应用是重点，实验力学则关注结构变形和安全性评估，如层状厚板壳和高层框架分析等。
结构工程方向主要关注计算理论、抗震设计、基础工程等方面，如改进地震反应分析方法、简化实用计算，以及功能抗震设计理论的研究。研究涉及网架结构分析、设计和施工，以及节点强度与构造的研究。
岩土工程则关注基础工程与地下结构，包括桩型桩性工作应用研究、特殊土的工程性质研究，以及区域性地质对工程的影响。市政工程则涉及城市给排水、道路桥梁设计和城市系统工程研究。
水资源与水工结构领域探讨水资源管理、水力问题、水工结构设计等，同时关注水能利用、水土保持和区域水资源可持续性。水力学及河流动力学则研究明渠水力学、河流泥沙等问题，包括多相流、给排水系统和暖通空调中的水流问题。
大地测量学与测量工程领域运用现代技术，如数字测绘、精密工程测量和GPS应用，进行高层建筑、桥梁变形监测等研究，以及航空摄影测量在土地资源管理和灾害监测中的应用。
自2006年至2008年，学院在科研方面取得了显著成果，承担国家和省部级项目多项，发表学术论文众多，同时积极为国家经济建设提供技术服务，积累了丰富的实践经验。
土木建筑工程学院的前身是安徽省立蚌埠高级工业职业学校土木科，是学校在1945年创办初期的三个专业之一。土木建筑工程学院现设有7个系，9个实验室和计算中心。现有本科专业6个，硕士学位授权点9个，工程硕士学位授权点2个，二级学科博士点2个，省级重点学科2个。全院现有教职工148人，其中教授18人，副教授及相应职称40人。教职工中有专任教师113人，其中博士学位及在读博士45人，硕士学位79人。目前学院共有学生2834人，其中全日制本科生2153人。博士、硕士学位研究生403人，工程硕士160人，研究生课程班学生118人。