间充质软骨肉瘤的发生通常源于骨组织，但也有少数病例起自软组织。其特征表现为密集的圆形细胞增生，这些细胞形态类似尤文氏肉瘤、淋巴瘤或血管外皮细胞瘤。这些细胞形状多样，有的呈圆形，有的呈卵圆形。
值得注意的是，这些小细胞具有独特的结构特征，显示出血管外皮细胞瘤样的或小泡样的形态。在组织内部，可以看到大小不一的软骨岛，这些软骨样区域在某些情况下可能不具备恶性特征。它们倾向于钙化和骨化，这是该疾病的一个重要特点。
间充质性软骨肉瘤是一种罕见的恶性软骨性肿瘤，多发生于青壮年。Lichtenstein等于1959年首例报道，而Dowling于1964年报道了首例起源于软组织的间充质性软骨肉瘤。直至1996年国外文献报道不足200例。