因为就近代的西方哲学史来看，
笛卡尔是第一个建立起一套完整的哲学体系的人。
他从数学中发现，人可以使用数学的思维方式来解决问题，也就是“理性”的方式。
他提出了《方法论》来分析研究问题的本质。
同时，他也是近代理性主义的代表，他的名言“
我思故我在”，证明了思想是唯一一种不可否定其存在的东西。
同时，身为二元论的支持者，笛卡尔指出，只要人类可以通过想象的方式将一个食物分成两个部分，那么这两样东西就一定是可以分离的。这句话，也就成为了灵魂存在理论的重要依据之一，因为没有人能证明这是错的。
笛卡儿被广泛认为是西方现代哲学的奠基人，他第一个创立了一套完整的哲学体系。哲学上，笛卡儿是一个二元论者以及理性主义者。笛卡儿认为，人类应该可以使用数学的方法——也就是理性——来进行哲学思考。他相信，理性比感官的感受更可靠。（他举出了一个例子：在我们做梦时，我们以为自己身在一个真实的世界中，然而其实这只是一种幻觉而已，参见庄周梦蝶）。他从逻辑学、几何学和代数学中发现了4条规则：
绝不承认任何事物为真，对於我完全不怀疑的事物才视为真理；
必须将每个问题分成若干个简单的部分来处理；
思想必须从简单到复杂；
我们应该时常进行彻底的检查，确保没有遗漏任何东西。
笛卡儿将这种方法不仅运用在哲学思考上，还运用於几何学，并创立了解析几何。
由此，笛卡儿第一步认为怀疑就是出发点，感官知觉的知识是可以被怀疑的，我们并不能信任我们的感官。所以他不会说「我看故我在」、「我听故我在」。从这里他悟出一个道理：我们所不能怀疑的是「我们的怀疑」。意指:我们无法去怀疑的，是我们正在「怀疑」这件事时的「怀疑本身」，只有这样才能肯定我们的「怀疑」是有真实性的，并非虚假的产物。人们觉得理所当然或习以为常的事物，他却感到疑惑，由此他推出了著名的哲学命题——「我思故我在」（Cogito ergo sum）。笛卡儿将此作为
形而上学中最基本的出发点，从这里他得出结论，「我」必定是一个独立於肉体的、在思维的东西。笛卡儿还试图从该出发点证明出上帝的存在。笛卡儿认为，我们都具有对完美实体的概念，由於我们不可能从不完美的实体上得到完美的概念，因此必定有一个完美实体——即上帝——的存在来让我们得到这个概念。从所得到的两点出发，笛卡儿继续推论出既然完美的事物(神)存在，那麼我们可以确定之前的恶魔假设是不能成立的，因为一个完美的事物不可能容许这样的恶魔欺骗人们，因此藉由不断的怀疑我们可以确信「这个世界真的存在」，而且经由证明过後的数学逻辑都应该是正确的。现实世界中有诸多可以用理性来察觉的特性，即它们的数学特性（如长、宽、高等），当我们的理智能够清楚地认知一件事物时，那麼该事物一定不会是虚幻的，必定是如同我们所认知的那样。
虽然笛卡儿证明了真实世界的存在，他认为宇宙中共有2个不同的实体，既思考(心灵)和外在世界(物质)，两者本体都来自於上帝，而上帝是独立存在的。他认为，只有人才有灵魂，人是一种二元的存在物，既会思考，也会占空间。而动物只属於物质世界。
笛卡儿强调思想是不可怀疑的这个出发点，对此後的欧洲哲学产生了重要的影响。我思故我在所产生的争议在於所谓的上帝存在及动物一元论(黑猩猩、章鱼、鹦鹉、
海豚、大象等等都证实有智力)，而怀疑的主要思想，确实对研究方面很有贡献。