外观上的区别、铭牌的区别、画质区别、电池区别。5d4比5d3要轻便和小巧，实际拿起5d4的时候也可以感觉到这一点，只不过毕竟是一台中端全画幅单反相机，说5d4轻便就有点过了，只是确实比上一代好一些。
5d4全称都标注在机身右上角的铭牌上，没有延续前两代Mark字样放置在右下角的设计。过去Mark标识的位置设置了快门线接口，这和机身侧面接口升级有关系。
佳能5d4独有全像素双核RAW，佳能5d4在开启全像素双核RAW拍摄时，可以同时将两个不同视点(正常影像和有视差的影像)的双像素数据和被摄体的纵深信息记录在一个RAW文档里，该文档是正常RAW文档的两倍，格式相同，但信息更丰富。
佳能5d4上使用的是LP-E6N的电池，外观大小与佳能5d3上的LP-E6一模一样，区别就在于5d4上的LP-E6N额定容量增加了50mAh，达到了1850mAh，即保证了两款机器的通用性同时也增加一些续航时间。