法律分析：根据相关的法律规定，处理公务员的违纪行为并对公务员的违纪行为作出处分决定时，应采取如下程序进行：（1）调查。应当由处分决定机关决定对公务员违纪的情况进行调查。（2）告知。将调查认定的事实及拟给予处分的依据告知公务员本人。（3）陈述和申辩。公务员有权进行陈述和申辩。（4）作出处分决定。处分决定机关认为对公务员应当给予处分的，应当在规定的期限内，按照管理权限和规定的程序作出处分决定。（5）通知。处分决定应当以书面形式通知公务员本人。
法律依据：《中华人民共和国公务员法》 第八十八条 公务员有下列情形之一的，予以辞退：（一）在年度考核中，连续两年被确定为不称职的；（二）不胜任现职工作，又不接受其他安排的；（三）因所在机关调整、撤销、合并或者缩减编制员额需要调整工作，本人拒绝合理安排的；（四）不履行公务员义务，不遵守法律和公务员纪律，经教育仍无转变，不适合继续在机关工作，又不宜给予开除处分的；（五）旷工或者因公外出、请假期满无正当理由逾期不归连续超过十五天，或者一年内累计超过三十天的。