延吉机场先后开通至长春、大连、北京、青岛、沈阳、烟台、深圳、沈阳、广州、成都和牡丹江、首尔、清州（韩国）等国际国内航线。先后有中国国际、南方、西南、东方、新华、长城、中原、上海，韩国大韩、韩亚等多家航空公司飞过延吉航线。
2000年8月，延吉机场临时对外开放，允许中、韩两国飞机经延吉机场出入境。2003年，国务院正式批复省政府，同意延吉机场对外开放，2004年6月，延吉航空口岸开放准备工作通过了省级预验收。2005年延吉航空口岸正式对外开放。2006年6月，中韩两国签署了民用航空备忘录，明确了延吉-首尔的包机运行变为正式航班，10月20日，经国家民航总局批准，延吉到首尔的航班由原来的每周8班增加到每周12班。
航空公司 起点城市 终点城市
中国国际航空公司
北京 延吉
首尔-仁川 延吉
中国南方航空公司北京-首都 延吉
釜山 延吉
长春-龙嘉 延吉
大连-周水子 延吉
广州-新白云 延吉
牡丹江 延吉
首尔-仁川 延吉
上海-虹桥 延吉
沈阳-桃仙 延吉
烟台-莱山 延吉
中国东方航空公司
上海-浦东 延吉
上海航空公司
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山东航空公司
青岛-流亭 延吉
上海-虹桥 延吉
大新华快运航空
沈阳-桃仙 延吉
天津-滨海 延吉
大韩航空公司
首尔-仁川 延吉
韩亚航空公司
首尔-仁川 延吉 航班号 航空公司 起点机场 起飞时间 目的机场 到达时间 班期 机型 CA1615 中国国际航空公司 北京首都 07:35 延吉 09:50 .2.4567 738 CZ6152 中国南方航空公司 北京首都 21:15 延吉 23:15 12.4.6. 321 CZ6152中国南方航空公司北京首都22:00延吉23:55..3.5.7321CZ6154 中国南方航空公司 北京首都 10:30 延吉 12:35 1.3.567 320 CZ3605 中国南方航空公司 长春 14:20 延吉 15:10 1234567 320 CZ6641 中国南方航空公司 长春 21:45 延吉 22:30 .2.3.6.. JET CZ6333 中国南方航空公司 大连 13:50 延吉 15:20 1.3.5.7 319 CZ3605 中国南方航空公司 广州 09:30 延吉 15:10 1234567 320 MU5671 中国东方航空公司 青岛 10:45 延吉 12:30 1.3.5.7 320 MU5651 中国东方航空公司 上海浦东 15:40 延吉 18:50 1.4.5.7 320 CZ6552 中国南方航空公司 上海虹桥 20:15 延吉 00:15 1234567 320 CZ6552 中国南方航空公司 烟台 22:10 延吉 00:15 1234567 320
