支付宝交新农合医保费用的步骤是：
1、打开你手机上面的“支付宝”APP，找到点击首页中的“更多”。
2、进入“更多”页面后，往下拉，找到“财富管理”-“资金往来”栏目，点击“转账”。
3、跳转到“转账”页面中，点击“转到银行卡”按钮。
4、填写你的姓名，在卡号处输入你的社保卡号，选取银行并输入金额后，点击“下一步”就完成了。
合作医疗的查询方法
1、携带身份证到当地乡镇卫生院的合管办或者到县合管办进行查询；
2、携带本人合作医疗证和身份证到当地新农合合作医疗机构查询；
3、可直接拨打社保电话12333进行查询。
总之，打开支付宝在更多应用界面点击“城市服务”，进入后，点击“社保”，即可根据提示进行缴费。
【法律依据】：
《中华人民共和国社会保险法》
第二十四条
国家建立和完善新型农村合作医疗制度。
新型农村合作医疗的管理办法，由国务院规定。
第二十五条
国家建立和完善城镇居民基本医疗保险制度。
城镇居民基本医疗保险实行个人缴费和政府补贴相结合。
享受最低生活保障的人、丧失劳动能力的残疾人、低收入家庭六十周岁以上的老年人和未成年人等所需个人缴费部分，由政府给予补贴。
第二十六条
职工基本医疗保险、新型农村合作医疗和城镇居民基本医疗保险的待遇标准按照国家规定执行。
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