东都镇的历史可以追溯到明朝洪武五年（公元1368年），当时这里有东都三官庙，庙中的碑文曾提及“明曰东渡僧西渡寺”，反映了早期的地理特点。在明代以前，东都与西都之间曾被湖水隔开，交通不便，人们需要通过渡船往来，因此东渡和西渡是当时的称呼。
到了明嘉靖三十五年（1566年），东都地区隶属于新泰县的娄德乡（南乡），这一时期它在行政上有所变动。到了清乾隆四十九年（1784年），东都归属新县上保南乡管辖。民国三（1914年），设立东都保，随后在民国十年（1921年），正式设为东都镇，标志着该地进入了新的行政阶段。
抗日战争期间，东都乡经历了多次变革。1941年9月，它成为泰宁县抗日民主政府岔河区的东都乡。1945年10月，又改称为新泰县抗日民主政府岔河区的都东乡。战争结束后，1950年初，东都乡隶属于新泰县大区，直至1959年11月，它被划归新汶市管辖。1962年4月，东都镇成为新汶市东都人民公社，开始了新的社会管理时期。
1984年2月，随着行政改革，东都镇隶属于新泰市新汶办事处，而到了1985年12月，撤乡并处时，原新泰市刘社办事处的栾庄乡并入东都镇，进一步扩大了其行政区域。
东都镇位于新泰市城南8公里处，总面积62.1平方公里。东临汶南镇，西校新汶办事处、岳家庄乡，北邻青云街道。镇机关驻地位于东社区，距市区6公里，由果东路、磁莱铁路与之联结，索馆公路、京沪高速公路横穿全境。辖31个行政村，8个自然村。总人口7.2万人，其中农业人口4.1万人。