慢性疾病，如：慢性呼吸系统、甲状腺或淋巴腺疾病等病可能导致患者循环系统不好，影响肢体末端供血，导致脚趾甲生长缓慢，角质层角化堆积，出现脚趾甲变厚的状况。
这种情况下，患者除了有脚趾甲增厚的病情，还会伴有身体其他不适现象或上述疾病史，可检查判断。
因慢性疾病导致的指甲变厚，需要就医检查先确诊具体病因，然后对症治疗才能从根本上治愈脚趾甲增厚的问题。另外日常还需多运动，补充营养，提高自身身体的抗病能力，才有可能彻底治愈这些慢性疾病。
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在临床上角化过度型脚癣也是引起脚趾甲变厚的原因之一，这种病症在引发脚趾甲变厚的同时，还会出现脚掌大部分弥漫发红，随着脚趾甲变厚出现皮肤增厚、粗糙、皮纹加深、干燥脱屑症状。
角化过度型脚癣，除了脚趾甲变厚，还会伴有足跟、足跖或足缘皮肤粗厚，皮肤纹理增宽加深，易发生皲裂，可因皲裂致出血及疼痛，根据这些作初步判断。
可用白凤仙花30克，皂角30克，花椒15克，任选—种，放入半斤醋内，浸泡一天后，于每晚临睡前泡脚20分钟或直接涂抹，连续治疗7天，对角化型有良效。或在专业的医师指导下使用抗真菌药物或中药煎汤外洗效果显著。
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还有一种病因，是可能患者本身就患有先天性脚趾甲变厚的现象。这种趾甲呈现黄绿色，不止脚趾甲变厚，还过度弯曲，游离缘如桶状或马蹄形，所有趾甲均可出现脚趾甲变厚症状，即使脱落后重长仍会使脚趾甲变厚。
这种病症只能采用物理手段削剥指甲，但需在专业的修脚师傅或医院进行操作，个人操作比较危险，要慎重。
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对于假指甲增厚程度较轻的情况，可先将双脚浸泡在温水中，软化干硬角质，并有助于促进血液循环。浸泡后，用去死皮刀把已经软化的增厚趾甲慢慢修剪，动作要轻，避免用力过大，伤害到趾甲旁边的皮肤。
用锉刀或刀片将增厚的病甲削薄，每周一次，同时每天涂药并包甲，或者白天涂抹药液，夜晚进行包甲交替进行，治疗2-3个月左右，涂抹药物与包甲期间应当注意保护好甲周皮肤，治疗期间禁止使用碱性肥皂。所涂药物和包甲主要为碘酊、冰醋酸、癣药膏等，具体药物使用需咨询医生。
手术拔甲用于个别或者少数灰指甲增厚的患者，需专业医生操作进行。主要是在其他药物治疗的基础上采用手术拔除病甲，或者用药物软化甲板后拔除。病甲拔除后，每天需要涂抹药物至新甲长出为止。
用老醋1000克，川楝子100克，将川楝子捣碎后放入老醋中煎煮，煎至醋剩下约500克左右去除药渣，用川楝子醋液每日浸泡变厚的脚趾甲，每日3次。