水务局和水利局没有区别，只是叫法不一样。
水利局是过去的叫法，现在统一更名为水务局。水务局是地方县区的政府职能部门，行政上的上级主管部门是所在县（区）政府，业务上的上级主管部门是水利厅。市水务局分管下属的县（区）水务局。
不管是水利局还是水务局都是政府的水行政主管部门，主要负责水利工程建设管理，防汛抗旱，水资源管理等，在职责区域内，负责开发、利用、节约、保护、管理水资源防治水害等的管理。水务局机关领导如局长、副局长或机关科室部分人员是公务员身份，水务局下属的水利工作站、水利服务站等工作人员为事业编，或聘用合同工。
水务局的主要职责
1、贯彻落实国家关于水务工作方面的法律、法规、规章和政策，起草本市相关地方性法规草案、政府规章草案，并组织实施；拟订水务中长期发展规划和年度计划，并组织实施。
2、负责统一管理本市水资源（包括地表水、地下水、再生水、外调水）；会同有关部门拟订水资源中长期和年度供求计划，并监督实施；组织实施水资源论证制度和取水许可制度，发布水资源公报；指导饮用水水源保护和农民安全饮水工作；负责水文管理工作。
3、负责本市供水、排水行业的监督管理；组织实施排水许可制度；拟订供水、排水行业的技术标准、管理规范，并监督实施。
4、负责本市节约用水工作；拟订节约用水政策，编制节约用水规划，制定有关标准，并监督实施；指导和推动节水型社会建设工作。
5、负责本市河道、水库、湖泊、堤防的管理与保护工作；组织水务工程的建设与运行管理；负责应急水源地管理。
以上内容参考：百度百科-水务局
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