说不上哪个好，根据游戏内容的不同可以自己选择
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口袋妖怪 黑2的封面是黑色酋雷姆，口袋妖怪 白2的封面是白色酋雷姆。
钥匙系统
通关之后，黑2获得“挑战钥匙”，白2获得“助手钥匙”。
黑色摩天楼第五区通关后，黑2获得“摩天楼钥匙”，白2获得“树洞钥匙”。
捕捉雷吉洛克后，黑2获得“铁钥匙”，白2获得“冰山钥匙”。
野生精灵
小鸭嘴龙、跳跳猪、噗噗猪、卷卷耳、长耳兔、木棉球、风妖精、哥德宝宝、哥德小童、哥德小姐、毛头小鹰是黑2专有的野生精灵。
电击怪、向尾喵、优雅猫、呆火驼、喷火驼、百合根娃娃、裙儿小姐、单卵细胞球、双卵细胞球、人造细胞卵、秃鹰小子是白2专有的野生精灵。
大甲黑2与赫拉克罗斯白2是版本专有的野生精灵，但在隐藏洞穴中，两者在同一个版本中出现。
猎斑鱼黑2与樱花鱼白2是版本专有的野生精灵，但其未进化型珍珠贝在两个版本中都有出现。
隐藏洞穴
巴大蝴是黑2的隐藏洞穴的专有精灵。
大针蜂是白2的隐藏洞穴的专有精灵。
赫拉克罗斯、恰雷姆在黑2的隐藏洞穴中的出现率高于白2。
大甲、超力王在白2的隐藏洞穴中的出现率高于黑2。
特殊精灵
在4号路上，黑2每周四出现一只隐藏特性的秃鹰娜，白2每周一出现一只隐藏特性的勇士鹰。
在小波湾上，黑2每周一出现一只隐藏特性的雄性胖嘟嘟，白2每周四出现一只隐藏特性的雌性胖嘟嘟。
通关后在龙螺旋之塔，黑2可以捕捉捷克罗姆，白2可以捕捉雷希拉姆。黑色酋雷姆与白色酋雷姆是酋雷姆与捷克罗姆或雷希拉姆合体而成，对合体的两只素材没有限制。
通关后在梦的遗址，黑2可以遇到拉帝欧斯，白2可以遇到拉帝亚斯。
在地底遗迹，使用黑2的“铁钥匙”可以开启雷吉斯奇鲁的房间，使用白2的“冰山钥匙”可以开启雷吉艾斯的房间，两把钥匙可以通信。
黑色摩天楼通关后可以获得闪光的圆陆鲨，白色树洞通关后可以获得闪光的迷你龙。
地形差异
4号路在两个版本中的外貌大幅差异，黑2是建设中的大楼，白2是挖掘中的古代遗迹。
反转山的山洞在两个版本中的地形不同，但主要出口的位置固定。
双龙市在黑2中呈现近未来外观，在白2中呈现自然外观。
黑2与白2中的等离子巡防舰构造及攻略顺序有明显区别。
冠军之路在两个版本中的地形略有差异，但训练家的位置大幅不同。
黑色城市与白色森林位于不同版本的同一个位置，通过通信“摩天楼钥匙”与“树洞钥匙”，可以在同一个游戏中切换黑色城市与白色森林的出现。