2005至2010年间，东华理工大学科研成果获国家或省部级奖励54项。其中国家级奖励9项，省部级奖励43项。共有17项自然科学类、人文社科类科研成果分获省级一、二、三等奖。获各级各类科研项目596项，其中国际原子能资助项目6项，国家级科研项目36项，省部级科研项目244项。
2010～2013年间，学校发表科研论文6000余篇，其中被SCI、EI、ISTP及SSCI收录1000余篇，出版专著、教材、译著80余部。获国家级或省部级奖励54项，发明专利10项。承担各级各类科研项目近800项、2012年科研项目经费突破1.2亿元，居江西第二。2010年10月，该校两篇科技论文首次入选2009年“中国百篇最具影响国际学术论文”。 2015年11月，根据《科技部关于认定农业航空应用技术国际联合研究中心等23家单位为2015年度国家级国际联合研究中心的通知》（国科发外[2015]352号）文件精神，经江西省科技厅推荐、科技部组织专家评审、研究确定，东华理工大学“质谱科学与仪器国际联合研究中心”被认定为2015年度国家级国际联合研究中心，这是江西省首个国家级国家联合研究中心，实现我校国家级国际联合研究中心零的突破。
截至2015年4月，学校拥有核资源与环境国家重点实验室培育基地、放射性地质与勘探技术国防重点学科实验室、国际原子能机构参比实验室等12个国家级、省部级重点实验室（工程技术中心、人文社科重点研究基地），以及铀资源勘查与开发协同创新中心和质谱科学与仪器协同创新中心2个江西省“2011协同创新中心”和4个省部级科技创新团队 。
（一）国家级国际联合研究中心
1、东华理工大学“质谱科学与仪器国际联合研究中心”
（二）国家级实验教学示范中心
1、放射性地质国家级实验教学示范中心
（三）省部级重点实验室
1、核资源与环境——江西省重点实验室、教育部重点实验室（省部共建国家重点实验室培育基地）
2、“放射性地质与勘探技术”国防重点学科实验室
3、江西省数字国土重点实验室（2004年2月被确定为省级重点实验室）
4、江西省环境地球化学重点实验室（省财政厅、省教育厅）
5、“地球环境”实验室（科技部国际合作基地和江西省国际合作基地）
6、“核资源与环境”国际合作基地
7、江西省质谱科学与仪器重点实验室
8、纳微构筑化学国际合作联合实验室南昌分支机构
9、“流域生态与地理环境监测”国家测绘地理信息局重点实验室（东华理工大学与江西省测绘地理信息局、江西师范大学和井冈山大学联合共建的国家测绘地理信息局重点实验室） 。 （四）工程研究中心
1、分析测试研究中心（国际原子能机构指定参比《仲裁》实验室，具备核地学重大科研课题的研究与测试）
2、“核技术应用”教育部工程研究中心
3、“核辐射探测及应用”江西省工程技术研究中心
4、核设施数字工程实验中心（江西省重点实验室）
5、地质资源经济与管理研究中心
（五）博士后科研工作站
1、江西省核资源与环境重点实验室博士后科研工作站
（六）博士后科研流动站
1、东华理工大学地质资源与地质工程博士后科研流动站 据2013年学校官网显示，东华理工大学图书馆围绕学校学科建设和专业发展，逐渐形成了以核地球科学、核技术、核分析化学、 水文地质与工程地质、测绘工程学科文献以及临川文化研究资料为重点收藏，文理管兼收的文献资源保障体系。
东华理工大学图书馆馆藏纸质图书159万册，电子图书41万册，购买了CNKI、超星数字图书馆等十多个大型文献数据库，并自建了临川文化名人、学科导航等特色数据库。 东华理工大学坚持开放式办学理念，积极开展全方位、多层次的国际交流与合作，陆续派出专家、教师出国考察，参加国际学术会议，据2013年学校官网显示，共出访20多个国家、80多批次、220多人次。2006年以来，先后派出10多位科学家去日本科技厅就高放废物地质处置问题开展合作研究。
与美国、俄罗斯、日本、澳大利亚等20多个国家或地区的高校和科研院所建立了长期校际交流和学术联系，并互派留学人员。与联合国国际原子能机构在科学研究、人才培养等方面建立了长期交流与合作关系。学校还长期聘任国外资深专家来校任教。
南昌的东华理工大学入选中西部高校基础能力建设工程（二期）（俗称小211工程）高校。东华理工大学是原核工业部第一直属高校，是工信部国家国防科工局、国土资源部、中核集团共建高校，是中核集团、中核建设集团人才培养基地，中国人民解放军海军后备军官选拔培训基地。获得省部级和央企多方共建，支持力度非常大是行业特色优势高校。
东华理工大学科研实力很强，有国家级国际联合研究中心，省部共建国家重点实验室，国家级实验教学示范中心，国防重点学科实验室等国家级科研平台，并且连续多年在江西科研经费排名第二。拥有全国第一个也是目前唯一一个核资源与环境国家重点实验室，核地质领域东华理工大学肯定是全国第一，世界有名。拥有江西省唯一一个国家级国际联合研究中心，江西省唯一一所入选 "111" 计划高校。
中国高校学术影响力排名，2015中国大学最具影响力百篇论文排行榜100强，东华理工大学排名全国53位，江西排名第一。2016中国大学最具影响力百篇论文排行榜100强，东华理工大学排名全国61位，江西排名第一。
东华理工大学2014年中国高被引学者榜单，江西省总共7位，东华理工排第二，有2位教授。两篇科技论文入选2009年“中国百篇最具影响国际学术论文”。是江西省仅有的两所高校入选研究生层次教育部卓越工程师计划高校。
东华理工大学2016年第一完成单位获得核技术领域国家科技进步二等奖。东华理工大学获得2015年中国机器人大赛暨RoboCup公开赛一等奖（亚军），获得2016年中国机器人大赛两项一等奖。