一、磁盘格式不同
1、NTFS：是Windows NT内核的系列操作系统支持的、一个特别为网络和磁盘配额、文件加密等管理安全特性设计的磁盘格式。
2、FAT32：是文件分配表是采用32位二进制数记录管理的磁盘文件管理方式，因FAT类文件系统的核心是文件分配表。
二、特点不同
1、NTFS：提供长文件名、数据保护和恢复，能通过目录和文件许可实现安全性，并支持跨越分区。
2、FAT32：FAT32文件系统中，除了根目录外，全部子目录均在被使用过程中，根据具体的需要而建立。若在根目录之下创建了一个新的子目录，则称该子目录是根目录的子目录，并且称根目录为该子目录的父目录。
三、优缺点不同
1、NTFS：支持元数据，并且使用了高级数据结构，以便于改善性能、可靠性和磁盘空间利用率，并提供了若干附加扩展功能。
2、FAT32：是稳定性和兼容性好，能充分兼容Win 9X及以前版本，且维护方便。缺点是安全性差，且最大只能支持32GB分区，单个文件也只能支持最大4GB。
参考资料来源：百度百科-FAT32
参考资料来源：百度百科-ntfs
本回答被网友采纳文件系统类型NTFS 和 FAT32区别为：分区容量不同、容错性不同、文件名不同。
一、分区容量不同
1、文件系统类型NTFS ：如果分区容量超过2GB，必须通过文件系统类型NTFS方式对其进行格式化
2、文件系统类型FAT32：文件系统类型FAT32最大支持2GB分区容量。
二、容错性不同
1、文件系统类型NTFS ：文件系统类型NTFS 可在不显示错误消息的情况下自动修复硬盘错误。
2、文件系统类型FAT32：文件系统类型FAT32未提供任何安全保护特性。
三、文件名不同
1、文件系统类型NTFS ：文件系统类型NTFS 的文件名不必以字母或数字开头，可以包含空格。此外，NTFS 文件名区分大小写字母。
2、文件系统类型FAT32：文件系统类型FAT32的文件名必须以字母或数字开头，并且不得包含空格。此外，FAT文件名不区分大小写字母。
本回答被网友采纳NTFS 和 FAT32是两种不同的磁盘文件格式，就像两个不同的图书馆，他们书架的摆放，尺寸各不相同，管理方式也各不相同。
NTFS (New Technology File System)，是 WindowsNT 环境的文件系统。新技术文件系统是Windows NT家族（如，Windows 2000、Windows XP、Windows Vista、Windows 7和 windows 8.1）等的限制级专用的文件系统（操作系统所在的盘符的文件系统必须格式化为NTFS的文件系统，4096簇环境下）。NTFS取代了老式的FAT文件系统。
FAT32是分区格式的一种。这种格式采用32位的文件分配表，使其对磁盘的管理能力大大增强，突破了FAT16对每一个分区的容量只有2 GB的限制。由于现在的硬盘生产成本下降，其容量越来越大，运用FAT32的分区格式后，我们可以将一个大硬盘定义成一个分区而不必分为几个分区使用，大大方便了对磁盘的管理。但由于FAT32分区内无法存放大于4GB的单个文件，且性能不佳，易产生磁盘碎片。目前已被性能更优异的NTFS分区格式所取代。
系统优点编辑
（1）更安全的文件保障，提供文件加密，能够大大提高信息的安全性。
（2）更好的磁盘压缩功能。
（3）支持最大达2TB的大硬盘，并且随着磁盘容量的增大，NTFS的性能不像FAT那样随之降低。
（4）可以赋予单个文件和文件夹权限。对同一个文件或者文件夹为不同用户可以指定不同的权限。在NTFS文件系统中，可以为单个用户设置权限。
（5）NTFS文件系统中设计的恢复能力无需用户在NTFS卷中运行磁盘修复程序。在系统崩溃事件中，NTFS文件系统使用日志文件和复查点信息自动恢复文件系统的一致性。
（6）NTFS文件夹的B-Tree结构使得用户在访问较大文件夹中的文件时，速度甚至比访问卷中较小的文件夹中的文件还快。
（7）可以在NTFS卷中压缩单个文件和文件夹。NTFS系统的压缩机制可以让用户直接读写压缩文件，而不需要使用解压软件将这些文件展开。
（8）支持活动目录和域。此特性可以帮助用户方便灵活地查看和控制网络资源。
（9）支持稀疏文件。稀疏文件是应用程序生成的一种特殊文件，文件尺寸非常大，但实际上只需要很少的磁盘空间，也就是说，NTFS只需要为这种文件实际写入的数据分配磁盘存储空间。
（10）支持磁盘配额。磁盘配额可以管理和控制每个用户所能使用的最大磁盘空间。