但是如果企业自身很少申报政府的科技项目，缺乏材料编写经验，或者某些条件不是很符合，又非常想要申请到这个证书，在这样的情况下，聘请专业有经验的服务机构中介机构代办，是企业通常的选择。
大家都知道，国家高新技术企业，企业可以自己申报或找代理机构申报，两者虽然各有利弊，但大部分已经成为高新技术企业的“过来人”一定会建议您找代理机构进行申报。
一、企业自己申报的弊端
1、企业很少申报项目。对过程和项目申报书不熟悉，没有思路和整体规划。
2、对政策的解读不够深入。而购买的专利是符合条件了，但是没有跟产品连接在一起，财务报表上也无法体现出来，结果是表面上符合了政策的条件，事实上是很明显的充数，专家一看就知道该企业不合适。
3、耗费大量精力和人力。申报材料由企业自行撰写，涉及的内容非常多。企业还需要自行递交材料、备案、办理流程。大部分企业都没有专门的部门去负责高新技术企业认定，导致申报的准备过程中可能耗费大量的精力和人力，也不一定能取得理想的效率和效果;
4、高新项目资料不只是一个一个条件拼凑这么简单的，四个板块是息息相关的，知识产权和审计有关，和财务有关，后面的RD、PS表都需要根据知识产权去编写。稍微不留意就很容易前后矛盾，一个小小错误就可以让专家的评分很低，导致无法通过。
5、成功率低。对于材料的质量要求逐年提高，辛苦完成的材料因各种问题被地方科技局打回票的也时有发生，有的问题有可能是不可逆的，从而企业错失了一年的申报时机，也浪费审计费和知识产权费用。
二、 找代理机构申报的好处
1、前期精准评估。代理机构在签约前会上门评估，综合考量企业各方面条件，以确保了通过率。
2、思路清晰，有整体规划。代理机构常年从事项目申报，对于高新技术企业申报条件、材料要求以及整套材料的编制、申报流程都非常清楚，能够根据不同企业的基本情况，编制符合要求的申报材料和指导企业提供有辅助作用的证明材料，尽可能弥补企业较弱的环节，同时提炼企业亮点之处为申报材料加分。
3、一条龙服务，省时、省力。规模大一点的代理机构，都有知识产权咨询师、资深税务筹划师、资深审计师等众多专业人员，能提供一条龙服务。如果企业在知识产权和审计这两块有欠缺，可以全包给代理机构，一站式解决，省时、省力。
4、熟悉流程。正规的代理机构常年从事项目申报，经常与相关部门有良好的工作沟通，知道什么问题找什么部门，这也能够为高企申报工作提供较大的便利和帮助。
1，多向科技局相关负责人请教，有专家辅导的时候一定要去。
2，知识产权一定要提前准备，不要跨申报年
3，研发费用要合理，充足
4，如果实在搞不懂，建议第三方，毕竟要3-5百多页材料呢。