社保卡和农村合作医疗之间会有冲突，很多人会选择优先使用社保卡的相关权益。
在多数情况下，如果一个人本身已经缴纳了社会保险，这个人就不需要再缴纳农村合作医疗保险了。对于城镇地区的居民来说，城镇地区的居民只能缴纳社会保险，有些人会通过单位的方式来缴纳社会保险，有些人也会通过个人的名义来缴纳单独的社会保险中的各个选项。对于乡镇地区的居民来说，因为乡镇地区的居民的收入能力有限，所以乡镇地区的居民可以按年来缴纳农村合作医疗保险。
社保卡和农村合作医疗会有冲突。
我们通常所指的社保卡是社会保险，如果拿社保卡和农村合作医疗做比较的话，社保卡中的医疗保险会提供相应的报销服务。在我们需要看病花钱的时候，因为医疗保险可以提供更高的报销比例，所以我们需要优先使用社保卡的相关服务。如果一个居民没有缴纳社会保险的话，居民则可以通过农村合作医疗的方式来提高自己的生活保障。
社保卡的优势在于服务种类健全和报销额度高。
因为社保卡的各项服务非常健全，里面不仅有我们经常使用到的医疗保险，同时也包括养老保险和其他生活类型的保险，所以社保卡的优势非常明显。对于多数居民来说，居民可以把社会保险理解为性价比最高的保险险种。
农村合作医疗的优势在于费用低。
当我们使用农村合作医疗的时候，我们看病花钱的报销比例一般在75%以内，乡镇地区的医疗机构的报销比例甚至只有45%左右。与此同时，因为农村合作医疗的保费相对比较低，所以农村地区的居民可以优先选择办理农村合作医疗保险。
社保卡里面包含一个医疗保险，然后创伤，居民医疗保险也是医疗保险，两者有一部分功能的交叉，但是又有一些区别。主要区别在于职工医疗保险本身的缴纳方式是偏向于连贯的，缴纳的费用更高，然后报销的比例更高，城乡居民医疗保险反之。
两者的区别就是职工医疗保险交的钱更多，而且是每个月缴纳的方式，城乡居民医疗保险交的钱比较少，是一年交一次，而且是年费变动。职工医疗保险是按照个人社保缴纳基数2%扣除，是说一个人社保缴纳基数3000块钱那一个月交60，1年交720块钱，如果第2年他社保缴纳基数变成5000了，那他一个月就交100块钱，一年交1200块钱。城乡居民医疗保险是以年费的方式存在的，这几年基本上是300块钱左右。
那两者的功能交叉只是都可以用来报销，城乡居民医疗保险的报销比例是在60%~80%，而职工医疗保险是个70%~95%。可能有人细心就发现了职工医疗保险报销比例更高啊，因为人家交的钱更多呀，城乡居民医疗保险一年才交300块钱，人家职工医疗保险社保缴纳基数到5000块钱的，一年交1200块钱，而且还有企业所跟这补交的6%~10%进入医疗保险大的资金池，那最终人家报销的时候比例自然就高。
两者虽然功能上有重合，但是自己觉得两个都教倒也不费什么事。因为职工医疗保险，如果从这单位辞职了，过一段时间职工医疗保险就会被冻结，这里面钱是有但他是去报销的功能的，在使用的时候可能还需要等一段时间，比较麻烦。城乡居民医疗保险一年交300块钱，它与个人的工作状态没有关系，就是一年没工作，住院了，城乡居民医疗保险同样可以给大家报销，这算是两者功能互补的一个地方。而且自己觉得一年300块钱这也不是什么特别高的费用，不至于负担不了。