要根据具体情况来确定。
（一）办理了农用地转建设用地审批手续，这类建设行为一般合法。
按照《全国土地利用现状分类》中的相关规定，设施农用地属于农用地。根据新版《土地管理法》中的相关规定，涉及农用地转为建设用地的，应当办理农用地转用审批手续。由此可以看出农用地上并非无法盖房，只是要依法办理农用地转用审批手续，将农用地转为建设用地，才能进行房屋建设施工。如果你建房前，已经将农用地依法转为建设用地，并办理了相应的手续，那就是不属于违法建筑了。但是，将农用地转为建设用地的审批程序非常复杂，需要行政机关的逐级审批。
（二）农业生产设施用房和农业附属设施用房属于违建吗？
一般农业项目区域内的附属建筑不会被认定为违建，比如，直接用于农产品生产的设施用房，包括养殖场中的畜禽舍、育种育苗房、简易的生产看护房等；直接辅助农产品生产的设施用房，包括设施农业配套的动植物疫病虫害防控、办公生活等管理和生活用房，以及存放农产品、饲料、农具和农产品分拣包装等必要的仓库、硬化晾晒场、生物质肥料生产场地等。
（三）需要特别提醒的是，设施农业经营者有下列行为的，必须依法依规办理建设用地手续。
1、以农业为依托的休闲观光度假场所、各类庄园、酒庄、农家乐和经营性住宅；
2、各类农业大棚、农业园区中建设的餐饮、住宅、会议、交易市场、仓储等非农业设施；
3、工厂化农产品加工、展销场所；
4、屠宰和肉类加工场所、病死动物专业集中无害化处理厂等；
5、其他类型的永久性建筑。
（四）以下情形会存在违建风险
1、小产权房：小产权房不是法律概念，是人们在社会实践中形成的一种约定俗成的称谓，一些开发商利用集体土地，尤其是农用地建设小产权房，这类小产权房因无法办理合法的不动产权登记证而难以再交易、出租，法律风险大，要谨慎购买。
2、大棚房：在耕地甚至永久基本农田上建设大棚房、生态园、休闲农庄等行为皆属违法，近年来，国家在大力打击大棚房。
3、建造别墅区：占用农用地建造别墅区，近几年陆续被纳入清理整治范围。
4、改变养殖场用途：有的养殖场亏本后，改造为仓库、物流经营场所、住房出租等，这便改变了土地的用途，相应的建筑物可能会被认定为违建。
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