首先，就目前的发展趋势来说，一本和二本的界限正在逐渐模糊，有些省市甚至已经在近几年率先进行改革不再区分一本二本，只分本科和专科高职两大类，去年的“双一流”建设名单公布之后，各省也都推出了本省的“双一流”建设计划，那也就意味着以后是否为“双一流”建设高校，以及在“双一流”建设中的定位将会取代传统的一本/二本的方式来进行大学之间层次的划分。
现在的一本大致上包括“985工程“建设高校、大部分“211工程”建设高校、一些有较深厚底蕴的部署/地方高校、本省内实力较强的高校或本省内普通高校的部分强势学科专业。
二本大致上就是除了一本批次外的公立本科高校，有的省市已经将二本和三本批次合并，这些省市的二本批次里也就包含着以前的三本院校（绝大部分为独立学院、民办高校）。
另外，一本和二本批次的区别并不会体现在毕业证和学位证上，就业时主要靠的是在校期间积累学习的个人能力以及学校在社会、行业内的口碑和影响力。例如一所大学在所在省份同时在一本和二本批次招生，毕业的时候，不管是以一本批次还是二本批次考入的，毕业证和学位证都是相同层次的，只是一本批次的专业有更强的师资力量或者有更高的社会认可度。
就当前情况来说，国内的本科院校大致可以分为以下几个大层次：
国家36所A类世界一流大学建设高校：北京大学、中国人民大学、清华大学、北京航空航天大学、北京理工大学、中国农业大学、北京师范大学、中央民族大学、南开大学、天津大学、大连理工大学、吉林大学、哈尔滨工业大学、复旦大学、同济大学、上海交通大学、华东师范大学、南京大学、东南大学、浙江大学、中国科学技术大学、厦门大学、山东大学、中国海洋大学、武汉大学、华中科技大学、中南大学、中山大学、华南理工大学、四川大学、重庆大学、电子科技大学、西安交通大学、西北工业大学、兰州大学、国防科技大学。
国家6所B类世界一流大学建设高校（其中东北大学、湖南大学、西北农林科技大学为原“985工程”建设高校）：东北大学、郑州大学、湖南大学、云南大学、西北农林科技大学、新疆大学。
国家世界一流学科建设高校：北京交通大学、北京工业大学、北京科技大学、北京化工大学、北京邮电大学、北京林业大学、北京协和医学院、北京中医药大学、首都师范大学、北京外国语大学、中国传媒大学、中央财经大学、对外经济贸易大学、外交学院、中国人民公安大学、北京体育大学、中央音乐学院、中国音乐学院、中央美术学院、中央戏剧学院、中国政法大学、天津工业大学、天津医科大学、天津中医药大学、华北电力大学、河北工业大学、太原理工大学、内蒙古大学、辽宁大学、大连海事大学、延边大学、东北师范大学、哈尔滨工程大学、东北农业大学、东北林业大学、华东理工大学、东华大学、上海海洋大学、上海中医药大学、上海外国语大学、上海财经大学、上海体育学院、上海音乐学院、上海大学、苏州大学、南京航空航天大学、南京理工大学、中国矿业大学、南京邮电大学、河海大学、江南大学、南京林业大学、南京信息工程大学、南京农业大学、南京中医药大学、中国药科大学、南京师范大学、中国美术学院、安徽大学、合肥工业大学、福州大学、南昌大学、河南大学、中国地质大学、武汉理工大学、华中农业大学、华中师范大学、中南财经政法大学、湖南师范大学、暨南大学、广州中医药大学、华南师范大学、海南大学、广西大学、西南交通大学、西南石油大学、成都理工大学、四川农业大学、成都中医药大学、西南大学、西南财经大学、贵州大学、西藏大学、西北大学、西安电子科技大学、长安大学、陕西师范大学、青海大学、宁夏大学、石河子大学、中国石油大学、宁波大学、中国科学院大学、第二军医大学、第四军医大学。
各省市“双一流”建设高校：如位于辽宁沈阳的东北财经大学、中国医科大学等等，数量太多，就不一一列举了。
最后，由于最新的“双一流”是动态调整机制，每隔几年就要评估一次，而且首批入选的“双一流”高校的学科存在着不少争议，例如原“985工程”的东北大学、湖南大学虽然只入选了B类世界一流大学建设名单，但是实际上无论是实力还是声誉都在其他几所之上；未能入选国家首批“双一流”的东北财经大学、江西财经大学、燕山大学等的优势学科无论是实力还是声誉并不输于很多入选了“双一流”建设名单的高校。所以目前来看还是按照原本的“985工程”、“211工程”以及2017年第四轮学科评估结果综合比较来择校比较稳妥一些。