法律分析：主要职能不同。森林公安局专门保护森林及野生动植物资源、保护生态安全、维护林区社会治安秩序的重要力量；普通公安局的业务可以简单划分为：刑事、治安、交通管理、消防、出入境、人口管理、国内安全保卫等。
法律依据：《公安机关办理刑事案件程序规定》 第三条 公安机关在刑事诉讼中的基本职权，是依照法律对刑事案件立案、侦查、预审;决定、执行强制措施;对依法不追究刑事责任的不予立案，已经追究的撤销案件;对侦查终结应当起诉的案件，移送人民检察院审查决定;对不够刑事处罚的犯罪嫌疑人需要行政处理的，依法予以处理或者移送有关部门;对被判处有期徒刑的罪犯，在被交付执行刑罚前，剩余刑期在三个月以下的，代为执行刑罚;执行拘役、剥夺政治权利、驱逐出境。